Publikace- strukturovaný seznam (takřka kompletní)

(a) Vědecké monografie a knihy
 
Bosák, P., J.Glazek, D.Ford, I. Horáček (eds.), 1989: Paleokarst. A Systematic and Regional Survey. Elsevier-Academia, Amsterdam-Praha. 728 pp.
Fejfar,O., I.Horáček, 1983: Zur Entwicklung der Kleinsäugerfaunen im Villányium und Alt-Biharium auf dem Gebiet der ČSSR.  Schriftenr. geol. Wiss., Berlin, 19-20: 111-208.
Hanák, V., I. Horáček, J.Gaisler (eds.), 1989: European Bat Research 1987. Charles Univ. Press, Praha. 718 + xxii pp.
Horáček, I.,  Gaisler, J., Hanák, V., 2000: The Bats of the Palearctic Region: a taxonomic and  biogeographic review.  pp. 11-157  In: Woloszyn, B.W. (ed.):  Proc. 8th EBRS, PAN Krakow.
Horáček, I., V.Ložek, 1988: Palaeozoology and the Mid-European Quaternary past: scope of the approach and selected results. Rozpravy ČSAV, ř.MPV, 98: 106 pp.
Horáček, I., V.Vohralík (eds.), 1992: Prague Studies in Mammalogy. Karolinum, Praha. 245 + xxii pp.
Horáček, I., J.Mlíkovský (eds.), 2001: Papers in paleomammalogy honoring Prof.Dr. Oldřich Fejfar. Lynx N.S. 33: 1-399.
Horáček, I., 2001:  On the early history of vespertilionid bats in Europe: the Lower Miocene record from the Bohemian Massif. Lynx 33: 123-154

(b) Kapitoly v monografiích

Bosák, P., I.Horáček, V.Panoš, 1989: Paleokarst in Czechoslovakia. pp. 107-135. In: Bosák et al. (eds.): Paleokarst. Elsevier-Academia.
Horáček, I., P.Bosák, 1989: Special characters of paleokarst studies. pp. 565-568. ibid.
Horáček, I., L.Kordos, 1989: Biostratigraphic investigations in paleokarst. pp. 599-612. ibid.
Horáček, I., 1999: Myotis dasycneme. pp. 108-109.  In: Mitchell-Jones A.J. et al. (ed.): The Atlas of European Mammals. Poyser Natural History London. 484 pp.
Horáček, I., 2000: Vertebrate remains in Horka-Ondrej: a summary. pp. 189-195 In: Kaminská L.: Horka-Ondrej: Research of a Middle Paleolithic Travertine Locality. Archaeologica Slovaca Monographiae XVII. AÚ SAV Nitra. 202 pp.
Horáček, I.: Historický vývoj fauny střední Evropy. In: Anděra, M., Hanák, V., Zima, J. (eds.): Fauna ČR - Savci. Academia, Praha (v tisku)
Horáček, I.: Vývojová minulost a chorologický status jednotlivých druhů. ibid.
Horáček, I.: Rod Plecotus.   ibid.
Horáček I., Dulic B., 2004: Plecotus auritus. Pp. 953-999 pp. 911-941 In: Krapp, F. (ed.): Handbuch der Saugetiere Europas. Vol.    Fledermause II.
Horáček I., Bogdanowicz W., Dulic B., 2004: Plecotus austriacus. Pp.1001-1049 In: Krapp, F. (ed.): Handbuch der Saugetiere Europas. Vol.    Fledermause II.
Horáček I., Benda P., 2004: Hypsugo savii. In: Krapp, F. (ed.): Handbuch der Saugetiere Europas. Vol.    Fledermause II.
Horáček I, 2003: What is a mammal?  pp. 3-17   In: Grzimek´s Animal Life Encyclopaedia, Vol 12 (Mammals – Vol. 1 of 5), Gale Inc. NY, 600 pp.
Horáček, I., R.Arlettaz: Genus Otonycteris and Otonycteris hemprichi. In: Kingdon J., D.Happold and T.Butynski (ed.): The Mammals of Africa. Academic Press, London. (v tisku)

Horáček, I., V,.Hanák, J.Gaisler 2005: Dlouhodobé změny biodiversity netopýrů: zpráva o nejrozsáhlejším monitorovacím programu v ČR 1969-2004. pp. 105-115 + 22 Obr. In: Vačkář D. (ed.): Ukazatele změn biodiverzity. Academia, Praha. 298 pp.

Dreslerová D., Horáček I., Pokorný P., 2007: Přírodní prostředí Čech a jeho vývoj. pp. 23-50 In: Kuna M. (ed.): Archeologie pravěkých Čech 1. Pravěký svět a jeho poznání. ArÚ AV ČR Praha 163 pp.

Horáček I., 2008: Jak se zviřátka rozkmotřila a co z toho pošlo. pp. 63-76 In: Pokorný P., Bárta M. (eds.): Něco překrásného se končí - Kolapsyv přírodě a společnosti. Nak. Dokořán, Praha, 255 pp.

Horáček I., 2008: K fotografii na frontispisu - epilog. pp.251-252  pp. 63-76 In: Pokorný P., Bárta M. (eds.): Něco překrásného se končí - Kolapsyv přírodě a společnosti. Nak. Dokořán, Praha, 255 pp.

Žák, K., Horáček I. & Cílek, V. (2021). Krajina vytvářená řekami a rozpouštěním vápence. pp. 27-47 In: Žák, K., Cílek V. & Majer, M. (eds.) Srdce Českého krasu. Dokořán, Praha  299 pp.
Horáček, I., Čermák, S. & Wagner, J. (2021). Po stopách čtvrtohorního života. pp. 48-68  In: Žák, K., Cílek V. & Majer, M. (eds.) Srdce Českého krasu. Dokořán, Praha  299 pp.
Horáček, i. (2021). Srbsko a netopýři. pp.258-259 In: Žák, K., Cílek V. & Majer, M. (eds.) Srdce Českého krasu. Dokořán, Praha  299 pp.
Horáček, I., Čermák, S. & Wagner, J.,(2021). Prof.RNDr.Oldřich Fejfar CSc. a Český kras. Český kras 47: 61 - 672022

Kipson, M., Gazaryan, S., & Horáček, I. (2022). Savi’s Pipistrelle Hypsugo savii (Bonaparte, 1837). In Handbook of the Mammals of Europe (pp. 1-18). Cham: Springer International Publishing.

Horáček, I. (2019). Family Rhinopomatidae (Mouse-tailed bats). pp. 164-177  In: Wilson D.E:  Mittermeier R.L. (eds.): Handbook of the Mammals of the World - Volume 9. Batsd. Lynx Edicion, Barcelona.
Horáček, I., Lehmann, T., Ruf, I., Krohmann, K., Maul, L.C. (2019). Gerhard Storch - a legend in mammals research. Fossil Imprint. 75: 5-21.
Horáček, I. & Trávníčková, E. (2019). Myotis gerhardstorchi sp.n. and comments on the European fossil record of Myotis frater group (Mammalia, Chiroptera). Fossil Imprint, 75(3-4), 315-342

Horáček, I. (2024). K5 Chování a evoluce: případ vzdušných letců.  Pp. 492 -511 In: Špinka, M. et al. (eds). Etologie. Academia, Praha.

(c) Původní práce a práce v recenzovaných sbornících

Horáček, I., 1967: Pražské havraní kolonie. Živa 15: 157.
Krátký.J., L.Hůrka, I.Horáček, 1969: Abendsegler (Nyctalus noctula) in Sommerquartieren von Mausohren (Myotis myotis) in Böhmen und der Slowakei. Myotis, Bonn, 7: 20-21.
Horáček, I., 1970: Zur Frage der Höchstalters tschechoslowakischen Fledermäuse. Myotis, Bonn, 8: 39.
Horáček, I., 1970: Myotis mystacinus, Eptesicus serotinus. In: Faunistické materiály z východních Čech. Práce a studie-přír., 2: 223.
Horáček, I., 1971: Neobvyklý způsob zimování netopýra pozdního (Eptesicus serotinus). Lynx, 12: 33-36.
Horáček, I., 1971: K výskytu netopýra brvitého (Myotis emarginatus) v Čechách. Lynx, 12: 37-42.
Horáček, I., 1971: Jugendtransport beim Mausohr (Myotis myotis). Myotis, Bonn, 9: 23-24.
Horáček, I., D.Vítek, A.Taušl, J.Červený, 1971: Issledovanije za drebnite bozajnicite na Rodopite. Rodopski peščernjak, Čepelare, 54:  40-44.
Horáček, I., 1973: Letní výskyt Corvus monedula soemmeringi ve východních Čechách. Práce a studie - přír., 5: 262-263.
Horáček, I., J.Červený, A.Taušl, D.Vítek, 1974: Notes on the mammal fauna of Bulgaria (Insectivora, Chiroptera, Rodentia). Věst.čs. spol. zool., 36: 19-31.
Horáček, I., 1975: Notes on the ecology of bats of the genus Plecotus Geoffroy, 1818 (Mammalia, Chiroptera). Věst.čs.spol. zool., 37: 195-210.
Horáček, I., J.Kročko, 1975: Zur Frage des Höchstalters tschechoslowakischer Fledermäuse II. Myotis, Bonn, 13: 61.
Horáček, I., 1976: Přehled výsledků a poznámky k metodice výzkumu netopýrů v jeskyních ČSSR. Krasový sborník Praha, 5: 5-30.
Horáček, I., 1976: Přehled kvartérních netopýrů Československa. Lynx, 18: 35-58.
Horáček, I., J.Zima, 1978: Net-revealed cave visitation and cave-dwelling in European bats. Folia Zool. Brno, 27: 135-148.
Gaisler,J., V.Hanák, I.Horáček, 1978: Present Status of Bat Research in Czechoslovakia. Bat Res.News, Ottawa-NY, 19: 37-46.
Horáček, I., J.Zima, 1978: Specifity of selection pressure as the factor causing parallel evolution in bats. Proc.Symp. Natural Selection, Praha. 115-124.
Zima, J., I.Horáček, 1978: Factors of diversification of mammalian taxa. ibid., 687-696.
Horáček, I., 1979: Poznámky ke kvartérním faunám jižních Čech - 1. Sudslavice (Chiroptera). Acta sci.nat.Mus. Bohem. merid., Č.Budějovice, 19: 73-76.
Horáček, I. 1979: Chiroptera. In: Šibrava,V. (ed.): Erforschung der Pleistozänablagerungen auf dem Hügel Zlatý kopec bei Přezletice (NO-Rand von Prag). Antropozoikum Praha, 12: 100-102.
Horáček, I., 1979: Výplně 4. sluje na Chlumu u Srbska a jejich význam pro kvartérní stratigrafii. Český kras Beroun, 4: 19-34.
Horáček, I., 1979: Mění se početnost netopýrů v Českém krasu? ibid. 5: 53-64.
Horáček, I., 1979: Poznámky k metodice kraniometrického výzkumu netopýrů. Lynx, 20: 111-112.
Horáček, I., J.Zima, J.Červený, 1979: Letní nálezy netopýrů na Slovensku: 1966-1977. Lynx, 20: 75-98.
Horáček, I., J.Zima, 1979: Zur Frage der Synanthropie bei Hufeisennasen in der Tschechoslowakei. Nyctalus, Berlin, 2: 68-71.
Horáček, I., 1980: Nová paleontologická lokalita na Zlatém koni u Koněprus. Čs.kras, Praha, 20: 105-107.
Horáček, I., 1980: Včeláre 3 - nová staropleistocenní lokalita Slovenského krasu. Slov.kras, Lipt.Mikuláš, 18: 183-192.
Horáček, I., 1980: Behaviorální struktury a pravidlo rekapitulace. Bull.Activ.Nerv. Super., Praha, 16.
Horáček, I., 1981: Comparative notes on the population structure in several European bat species. Myotis, Bonn, 18-19: 48-53.
Červený, J., I.Horáček, 1981: Comments on the life history of Myotis nattereri in Czechoslovakia. Myotis, Bonn, 18-19: 156-162.
Gaisler, J., V.Hanák, I.Horáček, 1981: Remarks on the current status of bat populations in Czechoslovakia. Myotis, Bonn, 18-19: 68-75.
Horáček, I., 1981: Comments on the lithostratigraphic context of the Early Pleistocene mammal biozones of central Europe. IGCP 24 Report 6, (Sess.1979), Praha: 99-117.
Gaisler,J., V.Hanák, I.Horáček (eds.), 1981: Výsledky zimního sčítání netopýrů v Československu: 1969-1979. Sborn. OM Most - přír., 3:    71-116.
Horáček, I., 1981: The Neogene and Quaternary faunas in the Bohemian Karst and their sigificance for the knowledge of this area. In: Bosák, P. (ed.): Jaroslav Petrbok Memorial volume. Stalagmit, Praha, Supl.: 9-18.
Horáček, I., V.Ložek, 1982: Vývoj přírodních poměrů na návrší Bašta u Hlubočep v poledové době. Čs.kras, Praha, 32: 21-39.
Horáček, I., 1982: K poznání glaciálních poměrů v krasu severního Bulharska. Čs.kras, Praha, 32: 95-103.
Horáček, I., V.Ložek, 1982: Ostrany u Rimavské Soboty - nové naleziště středopleistocenní fauny na Slovensku. Čs.kras, Praha, 32: 108-109.
Horáček, I., 1982: Výzkum fosilních obratlovců v CHKO Český kras. Pam. a přír., Praha, 1982: 106-111.
Bosák, P., J.Glazek, I.Horáček, A.Szynkiewicz, 1982: New locality of Early Pleistocene vertebrates - Zabia cave at Podlesice, Central Poland. Acta geol. Polon., Warszawa, 32: 217-226.
Bosák, P., I.Horáček, 1982: The investigation of old karst phenomena of the Bohemian Massif in Czechoslovakia: a preliminary regional evaluation. Proc.8th Int. Speleol. Congress, Bowling Green (N.M.): 167-169.
Bosák, P., I.Horáček, 1982: Kvartérní sedimenty jeskyně Niedzwiedzia v u Klentna (Polsko). Čs.kras, Praha, 33: 79-89.
Horáček, I., 1982: Perspektivy zpracovávání faunistických dat. Zprávy ČSZ, Praha, 17-18: 7-13.
Horáček, I., 1982: Význam studia fauny Balkánského poloostrova pro poznání vývoje savčí fauny ČSSR. Zprávy ČSZ, Praha, 17-18: 73-80.
Horáček, I., 1983: Biostratigraphic research in caves - its scope in karstogenetic studies in ČSSR. Proc.Symp. New Trends in Speleology. Stalagmit, Praha, Suppl. 1983: 20-22.
Horáček, I., 1983: Problems of cave-dwelling of European bats and their environmental implications. Proc.Europ. Reg.Conf. Speleology, Sofia, Vol. I: 163-169.
Horáček, I., 1983: Quaternary fossil karst in Czechoslovakia and its significance for the chronostratigraphic research. ibid.:
Bosák, P., J.Čadek, I.Horáček, J.Ulrych, J.Tůma, 1983: The development of the Na Turoldu cave (S-Moravia, Czechoslovakia). ibid.:
Horáček, I., V.Ložek, 1983: Paleontologické doklady a jejich stratigrafické zhodnocení. In: Bosák,P. (ed.): Krasové jevy vrchu Turold u Mikulova. Studie ČSAV, 5/84: 105 pp.
Horáček, I., 1983: Pokryvné uloženiny a fosilní výplně. ibid.
Horáček, I., 1983: Pobádenský vývoj bradla. ibid.
Horáček, I., 1983: Mokrá 1 - nová staropleistocenní obratlovčí fauna z Moravského krasu. Čs.kras, Praha, 34: 55-60.
Horáček, I., 1983: Obratlovčí fauna z jeskyně 1504 v Kodě. Český kras, Beroun, 7: 24-27.
Ložek, V., I.Horáček, 1983: Staropleistocenní fauna z jeskyně Na Skalce u Nového Mesta nad Váhom. Čs.kras, Praha, 35: 65-75.
Ložek, V., I.Horáček, 1983: Nález fauny ve vchodu Němcovy jeskyně v Moravském krasu. Čs.kras, Praha, 33:
Horáček, I., V.Ložek, 1983: Z výzkumu výplní Mladečských jeskyní u Litovle. Čs.kras, Praha, 35: 98-100.
Horáček, I., V.Ložek, 1983: Nález staropleistocenní fauny v krasových dutinách u Brekova. Čs.kras, Praha, 35: 100-102.
Hanák, V., I.Horáček, 1984: Some comments on the taxonomy of Myotis daubentoni (Kuhl, 1819) (Chiroptera, Mammalia). Myotis, Bonn, 21-22: 7-19.
Horáček, I., V.Hanák, 1984: Comments on the systematics and phylogeny of Myotis nattereri (Kuhl, 1818). Myotis, Bonn, 21-22: 20-29.
Horáček, I., 1984: Remarks on the causality of population decline in European bats. Myotis, Bonn, 21-22: 138-147.
Horáček, I., A.Sánchez-Marco, 1984: Comments on the Weichselian small mammal assemblages in Czechoslovakia and their stratigraphical interpretation. N.Jb.Geol.Paläont., Mh., 1984 (9): 560-576.
Horáček, I., 1984: Stratigraphy of sinter deposits in cave infills. In: Bosák, P. (ed.): New Trends in Speleology II, Stalagmit, Praha, Suppl. 1984:
Horáček, I., 1984: Obratlovčí mikrofauna z fosilních výplní Koněpruských jeskyní. Sb.Český kras, Beroun, 9: 68-75.
Horáček, I., 1984: Netopýři Koněpruských jeskyní. Sb.Český kras, Beroun, 9: 88-95.
Horáček, I., 1984: Obratlovčí mikrofauna z jeskyně 1504 (2.sdělení). Sb.Český kras, Beroun, 10: 18-21.
Horáček, I., 1984: Spolehlivost dat získaných Peterson-Lincolnovým indexem: testovací metoda. Lynx, Praha, 22: 79-82.
Horáček, I., J.Červený, 1984: K výskytu druhů Rhinolophus ferrumequinum a Rhinolophus euryale na Slovensku. Lynx, Praha, 22: 15-17.
Horáček, I., 1984: Nález Pipistrellus nathusii ve Slovenském krasu. Lynx, Praha, 22: 88.
Horáček, I., 1985: Population ecology of Myotis myotis in Central Bohemia. Acta Univ.Carolin. - Biol., 1981: 161-267.
Zima, J., I.Horáček, 1985: Synopsis of karyotypes of vespertilionid bats (Mammalia, Chiroptera). Acta Univ.Carolin. - Biol., 1981: 311-329.
Horáček, I., 1985: Survey of the fossil vertebrate localities Včeláre 1-7. Čas.min.geol., Praha, 30: 353-366.
Horáček, I., 1985: Quaternary morphoclines and changes in community structure in European shrews (Mammalia, Soricidae). In: Mlíkovský,J., V.J.A.Novák (eds.): Evolution and Morphogenesis, Praha: 799-810.
Bosák,P., I.Horáček, J.Sýkora, S.Tůma, 1985: Krasové jevy hřbetu Karžantau (západní Ťan-Šan, jižní Kazachstán). Čs.kras, Praha, 36: 85-96
Matoušek,V., J.Beneš, V.Ložek, I.Horáček, 1985: Zpráva o první sezoně revisního archeologického výzkumu jeskyně Axamitova brána. Sb.Český kras, Beroun, 11: 7-35.
Horáček, I., 1986: Kerivoula (Mammalia, Chiroptera), fossil in Europe? Acta Univ.Carolin. - Geol., Špinar Vol.2: 213-222.
Horáček, I., V.Hanák, 1985: Generic status of Pipistrellus savii and comments on classification of the genus Pipistrellus (Chiroptera, Vespertilionidae). Myotis, Bonn, 23-24: 9-16.
Horáček, I., J.Gaisler, 1985: The mating system of Myotis blythi. Myotis, Bonn, 23-24: 125-130.
Horáček, I., 1986: Fossil records and chorological status of dormice in Czechsolovakia. Part I: Glis glis, Eliomys quercinus. Folia Mus.rer.nat. Bohem. occid., Zoologica 24: 49-59.
Hanák,V., I.Horáček, 1986: Zur Südgrenze des Areals von Eptesicus nilssoni (Chiroptera, Vespertilionidae). Ann.Naturhist. Mus. Wien, 88-89, B: 377-388.
Horáček, I., V.Hanák, 1986: Comments on the generic status of Pipistrellus savii and systematics of the genus Pipistrellus. Bat Res. News, N.Y.
Horáček, I., V.Ložek, 1987: Staropleistocenní fauna z Honců ve Slovenském krasu. Čs.kras, Praha, 38: 133-134.
Ložek,V., I.Horáček, 1987: K otázce stáří suťových brekcií u Slavce v Slovenském krasu. Čs.kras, Praha, 38: 132-133.
Horáček, I., 1987: Fossil records and chorological status of dormice in Czechoslovakia. Part II. Dryomys and Muscardinus. Folia Mus. Rer.nat. Bohem. occid., Zoologica 26: 79-96.
Ložek,V., I.Horáček, L.Gaál, 1987: Stratigrafický výzkum jeskyne Mara Medvedia pri Divíne. Prehlad odb. výsl. XXII TOP, Uhorské  1986: 17-26.
Zima, J., I.Horáček, J.Hošek, 1987: Nálezy rejska horského (Sorex alpinus) a myšice temnopásé (Apodemus agrarius) ve Slovenském  krasu. Lynx, Praha, 23: 103-105.
Jančařík, P., I.Horáček, 1988: Fauna subfossile di piccoli mammiferi nella grotta dell'Ausino (M.Alburnini) in Italia meridionale. L'Appennino Meridionale, Napoli, 1988: 185-186.
Horáček, I., V.Ložek, 1988: Přehled nových výzkumů v kvartéru biosferické reservace Slovenský kras. Čs.kras, Praha, 39: 61-68.
Ložek, V., I.Horáček, 1988: Vývoj přírody Plešivecké planiny v poledové době. Ochrana prírody, Bratislava, 6A: 151-175.
Zima,J., I.Horáček, J.Červený, 1989: Karyotypes of Eptesicus bottae and some other vespertilionid bat species from Soviet Central Asia. pp. 105-110 In: Hanák,V., I.Horáček., J.Gaisler (eds.): European Bat Research 1987, Charles Univ. Press, Praha.
Rybin, S.N., I.Horáček., J.Červený, 1989: Bats of Southern Kirghizia: Distribution and Faunal Status. pp. 421-441. ibid.
Hošek,J., I.Horáček, 1989: Nematodes parasiting the Palearctic bats: host-parasite relations. pp. 465-474. ibid.
Horáček, I., V.Hanák, 1989: Distributional status of Myotis dasycneme. pp. 565-590. ibid.
Ložek, V., Gáal,L., P.Holec, I.Horáček, 1989: Stratigrafia a kvartérna fauna jeskyne Pesko v Rimavskej kotline. Slov.kras, 27: 29-56
Horáček, I., V.Ložek, 1990: Biostratigrafický výzkum rozsedliny na Martince. Čs.kras, Praha, 41: 83-100.
Horáček, I., V.Ložek, 1990: Středopleistocenní fauna u Kuchaříku v Českém krasu. Čs.kras, 41: 124-125.
Fejfar,O., I.Horáček, 1990: Review of fossil arvicolids (Mammalia, Rodentia) of the Pliocene and Quaternary of Czechoslovakia. Int.Symp.Evol.Phyl.Biostr.Arvicolids, Praha: 125-132.
Horáček, I., 1990: On the community context of the arvicolid Quaternary evolution. Int.Symp.Evol.Phyl.Biostr.Arvicolids, Praha: 201-222.
Horáček, I., N.Poulianos, 1990: Further data on bats of the Early Pleistocene site, Petralona. Antropos, Athens, 12: 50-58.
Horáček, I., 1991: Enigma of Otonycteris: ecology, relationship, classification. Myotis, Bonn, 29: 17-30.
Zima,J., J.Červený, I.Horáček, 1991: Standard karyology of eighteen species of bats (Rhinolophidae, Vespertilionidae, Molossidae) from Eurasia. Myotis, Bonn, 29: 31-34.
Fejfar, O., I.Horáček, 1992: A Miocene vertebrate fauna in Suchomasty. Czechoslovak Paleontology, ..
Cílek, V., I.Horáček, 1992: Nález koně , Equus sp., v lomu Paraple ve Sv.Janu pod Skalou. Speleo, Praha, 7: 25.
Ložek, V., I.Horáček, 1992: Slovenský kras ve světle kvartérní geologie. Slov.kras, Lipt.Mikuláš, 30: 29-56.
Zima, J., M.Volleth, I.Horáček, J.Červený, M.Macholán: Karyotypes of two species of bats, Otonycteris hemprichi and Pipistrellus tramatus (Chiroptera, Vespertilionidae). pp. 237-242. In: Horáček, I., V.Vohralík (eds.): Prague Studies in Mammalogy, Karolinum, Praha.
Zima, J., M.Volleth, I.Horáček, J.Červený, 1992: Comparative karyology of rhinolophid bats (Chiroptera: Rhinolophidae). pp. 229-236. In: Horáček, I., V.Vohralík (eds.): Prague Studies in Mammalogy, Karolinum, Praha.
Horáček, I., V.Hanzal, 1993: Causa Amerika. Speleo, Praha, 9:
Horáček, I., V.Ložek, 1993: Biostratigraphic investigation in the Hamorská cave. pp. 49-60 In: Cílek, V. (ed.): Karst sediments. The Fossil Record of Climate Oscillations and Environmental Changes. Cz. Spel. Soc., Praha, 96 pp.
Benda P., Horáček I., 1994: Biometrics of Myotis myotis and  Myotis blythi. Myotis, Bonn, 32-33: 45-55.
Benda P., Horáček I., 1995: Geographic variation in three  species of Myotis (Mammalia: Chiroptera) in South of the  Western Palearctics. Acta Soc.Zool.Bohem. 59: 17-39.
Horáček I., Hanák, V., Zima, J., Červený J., 1995: K netopýří  fauně Slovenska 1979-1995. Netopiere l, Bratislava: 39-54
Horáček I., 1995: K formování středoevropské netopýří fauny. Netopiere 1, Bratislava: 93-98
Horáček I., 1995: Totální albinismus u vrápence malého  (Rhinolophus hipposideros). Netopiere 1, Bratislava: 105-108.
Kovanda J., Smolíková L., Horáček I., 1995: New data on four  classical loess sequences in Lower Austria. Antropozoikum 22: 63-85.
Kovanda J., Smolíková L., Ford D., Kaminská L., Ložek V., Horáček I., 1995: The Skalka travertine mound at Horka-Ondrej  near Poprad (Slovakia). Antropozoikum 22: 113-140.
Uhrín M., Horáček I., Šíbl J., Bego F., 1996: Survey of  bat records from Albania. Acta Soc.Zool.Bohem.,  60: 63-71.
Uhrín, M., Obuch, J., Horáček, I. et al.: Status of Rhinolophidae in Slovakia. Acta Soc.Zool. Bohem. 60:  247-279.
Horáček, I., 1997: Status of Vesperus sinensis Peters, 1880 and remarks on the genus Vespertilio. Vespertilio, 2: 59-72
Horáček, I., 1997: Comments on Vespertilio majori Kormos, 1934.  Ibid.:  131-133.
Benda, P., I.Horáček, 1998:  Bats (Mammalia:Chiroptera) of the Eastern Mediterranean. Part 1. Review of distribution and taxonomy of bats in Turkey.  Acta Soc.Zool.Bohem., 62: 255-313.
Horáček, I., 1999: Vertebrate fauna from the Pod Zubem rockshelter. Archeologické rozhledy 51: 268
Horáček, I., 2000:  Glacial Cycles and Mammalian Biodiversity of Central Europe: Large Scale Migrations or Vicariance Dynamics? Geolines 11: 103-107.
Weinfurtová, D., Horáček, I., 2000:  Netopýr severní  (Eptesicus nilssonii) ve středních Čechách. Lynx N.S.. 31: 149-152.
Němec, P., Koudelková, H., Druga, P, Horáček, I: Spinal cord in bats: implications of phylogenetic studies. Lynx N.S. 31: 81-111.
Svoboda, J., Horáček, I., Ložek, V.,, Svobodová, H., Šilar, J., 2000: The Pekárna Cave. Magdalenian stratigraphy, environment and the  termination of the loess formation in Moravian Karst. Antropozoikum 24: 61-79.
Cílek,V., Horáček, I., Hlaváč, J., 2000: Biostratigraphic investigations in U  hamru cave, Dobrkovice  near Český Krumlov. Speleo.29: 18-20.
Horáček, I., 2000: Nálezy mladocenozoické fauny v Českém krasu a jejich význam pro poznání morfogenese této oblasti. pp. 40-48 In: Cílek, V., Bosák P. (eds.): Zlatý kůň. Knihovna CSS 36. Praha
Němec, P.; H. Koudelková, R.Druga and I. Horáček, 2000: Structure of the Chiropteran Spinal Cord: Implications for the Phylogenetic Systematics. J. Morphol. 248: 266.
Bosák, P., Vašátko, J. Horáček, I., 2001: Czech Republic. pp. 1405-1426 In: Juberthie, C. (ed.): Encyclopaedia Biospeleologica III.
Hanák, V., Benda, P., Ruedi, M., Horáček, I., Sofianidou T. 2001: Bats of the Eastern Mediterranean. Part 2: Review of distribution and taxonomy of bat in Greece. Acta Soc.Zool. Bohem. 64: 277-346
Horáček, I., 2001: Sčítání netopýrů v zimovištích ČR: 1969-2001. Vespertilio 5: 3-5.
Horáček, I. (ed.), 2001: Nejvýznamnější zimoviště netopýrů ve středních Čechách. Vespertlio 5: 121-145.
Nová, P., Malý, P., Horáček, I., Hanák, V., Sádovská, E., 2001: Zimoviště netopýrů v podzemí Sedlčansko-krásnohorského metamorfovaného ostrova. Vespertilio, 5: 187-189.
Horáček I., Ložek, V., Svoboda, J., Šajnerová, A., 2002: Přírodní prostředí a osídelní krasu v pozdním paleolitu a mezolitu. pp. 313 – 354  In:  Svoboda, J. (ed.): Prehistorické jeskyně: katalogy, dokumenty, studie. AÚ AV ČR Brno, 406 pp.
Horáček, I., 2002: Fosilní obratlovci lokality Bacín. pp. 292- 293. In:  Svoboda, J. (ed.): Prehistorické jeskyně: katalogy, dokumenty, studie. AÚ AV ČR Brno, 406 pp.
Hulva, P., Horáček, I., 2002: Craseonycteris thonglongai (Chiroptera, Craseonycteridae) is a rhinolophoid: molecular evidence from cytochrome b. Acta Chiropterologica, 4: 107-120.
Horáček I., 2003: Obratlovčí fauna z pískovcových převisů severních Čech. pp. 48 – 57. In: Svoboda J. (ed.): Mezolit severních Čech. AÚ AV ČR Brno. 328 pp.
Svoboda J., Ložek V. Horáček I., Opravil E., Novák M., Jenč P., Peša V., 2003: Katalog lokalit. pp. 113-296  In: Svoboda J. (ed.): Mezolit severních Čech. AÚ AV ČR Brno. 328 pp.
Benda P., Ivanova T., Horáček I., Hanák V., Červený J., Gaisler J., Gueorguieva A., Petrov B., Vohralík V., 2003: Bats (Mammalia: Chiroptera) of the Eastern Mediterranean. Part 3. Review of bat distribution in Bulgaria. Acta Soc.Zool. Bohem. 67: 245-356.

Hulva P., Horáček I., Strelkov P. P. & Benda P., 2004: Molecular architecture of Pipistrellus pipistrellus / P. pygmaeus (Vespertilionidae) complex: further cryptic species and Mediterranean origin of the divergence. Molecular Phylogenetics and Evolution, 32: 1023–1035.
Benda P., Ivanova T., Horáček I., Hanák V., Červený J., Gaisler J., Gueorguieva A., Petrov B., Vohralík V., 2004: Bats (Mammalia:Chiroptera) of the Eastern Mediterranean. Part 3. Review of bat distribution in Bulgaria. Acta Societatis Zoologicae Bohemicae, 67: 245–357.
Horáček I. & Jahelková H., 2005: History of the Pipistrellus pipistrellus group in Central Europe in light of its fossil record. Acta Chiropterologica, 7: 189–204.
Černý R., Horáček I. & Olsson L., 2006: The Trabecula cranii: development and homology of an enigmatic vertebrate head structure. Animal Biology, 56: 503–518.
Hoofer S. R., Van Den Bussche R. A. & Horáček I., 2006: Generic status of the American pipistrelles (Vespertilionidae) with description of a new genus. Journal of Mammalogy, 87: 981–992.
Hulva P. & Horáček I., 2006: Cryptic sympatric diversity in Emballonura alecto: further bats species? Acta Chiropterologica, 8: 537–542.
Horáček, I., 2006: Small vertebrates in the Weichselian series in Dzeravá skala cave: list of the samples and a brief summary. pp. 157-167  In: Kaminska L., Kozlowski J.K., Svoboda J.A. (eds.): Pleistocene Environments and Archaelogy of the Dzerava skala Cave, Lesser Carpathians, Slovakia. PAN Krakow. 226 pp.
Pokorný, P., Horáček I., 2006: Přírodní rámec nejstaršího osídlení jižních Čech. pp. 325-343. In: Vencl, S. (ed.): Nejstarší osídlení jižních Čech. AÚ AVČR Praha. 473 pp.
Sedláček O., Hořák D., Riegert J., Reif J., Horáček I., 2006: Comments on Welwitsch´s mouse-eared bat (Myotis welwitschi) with the first record from Cameroon. Mammalian Biology 71: 120-123.
Hulva P, Horáček I, Benda P, 2007: Molecules, morphometrics and new fossils provide an integrated view of the evolutionary history of Rhinopomatidae (Mammalia: Chiroptera). BMC Evolutionary Biology 2007, 7:165
Horáček I., Fejfar O. & Hulva P., 2006: A new genus of vespertilionid bat from Early Miocene of Jebel Zelten (Libya) with comments of Scotophilus and early history of vespertilionid bats. Lynx, n. s., 37: 131–150.
Černý R., Horáček I. & Galis F. (eds), 2006: The First and Founding meeting of the European Society for Evolutionary Developmental Biology, Prague, August 2006 – Proc.Abstracts. Charles Univerity, Praha, 364 pp.
Čermák S., Wagner J., Fejfar O., Horáček I., 2007: New Pliocene localities with micromammals from the Czech Republic: a preliminary report. Fossil Record 10: 60-68.
Horáček I., 2007: Holocene history of the mammalian fauna in the Northern Bohemian sandstone region (Czech Republic), pp. 265-272 In:  Sandstone Landscapes. Academia, Praha.
Horáček I., Mihevc A., Zupan Hajna N., Pruner P., Bosák P., 2007: Fossil  vertebrates and paleomagnetism update of  one of the earlier stages of cave evolution in the classical karst, Slovenia: Pliocene of Črnotiče II site and Račiška pečina. Acta Carsologica 36: 111-128.
Sabol M., Fejfar O., Horáček I., Čermák S., 2007: The Early Miocene micromammalian assemblage from Mokrá - 1/2001 Turtle Joint site (Moravia, Czech Republic) - preliminary results. Scripta. Fac.Sci.Nat.Uni.Masaryk, Brno, 36: 57-64.
Ložek V., Horáček I., 2007: Molluscan and vertebrate successions from the Velká Ružínská Cave (East Slovakia).  pp. 217-225  In: Festschrift fur Klaus Dietrich Jaeger  zum 70 Geburtstag. Terra Prehistorica
Svoboda J., Hajnalová M., Horáček I., Novák M., Přichystal A., Šajnerová A., Yaroschevich A., 2007: Mesolithic settlement and activities in rockshelters of the Kamenice river canyon, Czech Republic. Eurasian Prehistory 5: 65-127.
Svoboda J.A., Hajnalova M., Horáček I., Novák M., Přichystal A., Šajnerová A.,. 2007: Okrouhlík. Výzkum mezolitického sídelního areálu v soutěsce Kamenice v roce 2005.  Minulost Českého Švýcarska V: 5-37.
Horáček I., 2007:  Developmental dynamics of chiropteran molars: on variation and constraints. JVP 27 (3): 91A
Landová E., Horáček I., Frynta D., 2006: Have black rats evolved a culturally-transmitted techniques of pinecone opening independently in Cyprus and Israel?  Israel J. Ecol. Evolution, 52: 151-158.
Benda P., Hanák V., Horáček I., Hulva P., Lučan R. & Ruedi M., 2007: Bats (Mammalia: Chiroptera) of the Eastern Mediterranean. Part 5. Bat fauna of Cyprus: review of records with confirmation of six species new for the island and description of a new subspecies. Acta Societatis Zoologicae Bohemicae, 71: 71–130.
Hulva P., Benda P., Hanák, Evin A. & Horáček I., 2007: New mitochondrial lineages within the Pipistrellus pipistrellus complex from Mediterranean Europe. Folia Zoologica, 56: 378–388.
Hulva P., Horáček I. & Benda P., 2007: Molecules, morphometrics and new fossils provide an integrated view of the evolutionary history of Rhinopomatidae (Mammalia: Chiroptera). BioMedCentral Evolutionary Biology, 7: 165.

Lučan R..K., Horáček I., Hulva P., Benda P., 2007: První doklad rozmnožování netopýra pobřežního (Myotis dasycneme) v České republica a nový letní nález netopýra východního (Myotis blythii) na jihovýchodní Moravě. Lynx (Praha), n.s., 38: 109-112.
Jahelková H., Horáček I,, Bartonička T., 2008: The advertisement song of Pipistrellus nathusii (Chiroptera, Vespertilionidae): a complex message containing acoustic signatures of individuals. Acta Chiropterologica 10: 103-126.
Soukup V., Epperlein H-H., Horáček I, Černý R., 2008: Dual epithelial origin of vertebrate oral teeth. Nature. doi: 10.1038/nature/07304.

Soukup V., Epperlein H-H., Horáček I, Černý R., 2008: Dual epithelial origin of vertebrate oral teeth. Nature. 455:795-798  / doi: 10.1038/nature/07304.

Zahradnicek O., Horacek I., Tucker A.S., 2008: Viperous fangs: development and evolution of the venom canal. Mechanisms of Development, 125: 786-796.   IF  3,160
Lucan R., AndreasM., Benda P., Bartonička T., Březinová T., Hoffmanová, A., Hulová Š., Neckářová J., Reiter A., Svačina T., Šálek M., Horáček I., 2009: Alcathoe bat (Myotis alcathoe) in the Czech Republic: distributional status, roosting and feeding ecology. Acta Chiropterologica. 11:  61-69.             IF  1,129
Spoutil F., Vlcek V., Horáček I., 2010: Enamel Microarchitecture of a Tribosphenic Molar. Journal of Morphology, 271: 1204 - 1218.   IF 2,087
Martinkova N. Bačkor P., Bartonička T. … Jahelková H., …Lučan R.K., …Zima J., Horáček I., 2010: Increasing incidence of Geomyces destructans Fungus in Bats from the Czech Republic and Slovakia. PlosONE, 5/11: e13853: 1-7.  IF  4,610
Lucan R. K., Hanák V. & Horáček I., 2009:  Long-term re-use of tree roosts by European forest bats. Forest Ecology and Management, 258, 1301-1306.  IF 2,507
Královič M., Horáček I., Černý R., 2010:  Mouth development in the Senegal bichir Polypterus senegalus does not involve the oropharyngeal membrane: possible implications for the ecto-endoderm boundary and tooth initiation. Journal of Applied Ichthyology, 26, 179-182. IF 1,117
Horáček, I., P. Benda, R. Sadek, S. Karkabi, M. Abi-Said, R. Lučan, P. Hulva, and R. Karanouh. 2008. Bats of Lebanon. State of knowledge and perspectives. Al-Ouat’Ouate, Revue Libanaise de Speleologie et de Karstologie, N. S., 14: 52–67.
Horáček, I., P. Benda, R. Sadek, S. Karkabi, M. Abi-Said, R. Lučan, M. Uhrin, I. Bou Jaoude, R. Karanouh, and S. Akil. 2009. Bat census in Lebanese caves in 2008 & 2009. Al-Ouat’Ouate, Revue Libanaise de Speleologie et de Karstologie, N. S., 15: 70–73.
Benda P., Georgiakakis P., Dietz C., Hanák V., Galanaki K., Markantonatou V., Chudárková A., Hulva P. & Horáček I., 2009: Bats (Mammalia: Chiroptera) of
the Eastern Mediterranean and Middle East. Part 7. The bat fauna of Crete, Greece. Acta Societatis zoologicae bohemicae [Praha], 72: 105–190.
Hanák V., Neckářová J., Benda P., Hanza l V., Anděra M., Horáček I., Jah elková H., Zieglerová A. & Zieglerová D., 2009: Bat fauna of Prague: review of records with notes on the urban populations. Natura Pragensis [Praha], 19: 3–89.
Kučera J., Sůvová Z., Horáček I., 2009: Stránská skála jeskyně: glacialní společenstvo hlodavců (Rodentia) ze staršího středního pleistocenu. Lynx n.s., 40: 43-69.
Čermák S., Wagner, J., Morávek, R., Fejfar, O., Horáček, I., 2010: Pliocenní fauna obratlovců z krasových výplní vápencového lomu ve Vitošově na severní Moravě. Zprávy Vlastivědného muzea v Olomouci, 299, s. 20–36.
Horáček, I., Benda P. (eds.), 2010: 15thIBRC – the Conference Manual.  Abstracts of the 15th International Bat Research Conference, Prague 23-27 August 2010.  380 pp.
Horáček I., Uhrin M. (eds.), 2010: A tribute to bats. Lesnická práce, Kostelec, 400 pp.
Hanák V., Anděra M., Uhrin M., Danko Š. & Horáček I., 2010: Bats of the Czech Republic and Slovakia: distributional status of individual species. Pp.: 143–254. In: Horáček I. & Uhrin M. (eds.): A Tribute to Bats. Lesnická práce, Kostelec nad Černými lesy, 400 pp.
Horáček I., 2010: Monitoring bats in underground hibernacula. Pp.: 93–108. In: Horáček I. & Uhrin M. (eds): A Tribute to Bats. Lesnická práce s.r.o., Kostelec nad Černými lesy, 400 pp.
Horáček I., 2010: … until now. Pp.: 31–39. In: Horáček I. & Uhrin M. (eds): A Tribute to Bats. Lesnická práce s.r.o., Kostelec nad Černými lesy, 400 pp.
Jahelková H. & Horáček I., 2010: Advertisement behaviour and mating system of the migratory bat Pipistrellus nathusii. Pp.: 302–305. In: Horáček I. & Uhrin M. (eds): A Tribute to Bats. Lesnická práce s.r.o., Kostelec nad Černými lesy, 400 pp.
Královič M., Horáček I. & Černý R., 2010: Mouth development in the Senegal bichir Polypterus senegalus does not involved the oropharyngeal membrane: possible implications for the ecto-endoderm boundary and tooth initiation. Journal of Applied Ichthyology, 26: 179–182.
Martínková N., Bačkor P., Bartonička T., Blažková P., Červený J., Falteisek L., Gaisler J., Hanzal V., Horáček D., Hubálek Z., Jahelková H., Kolařík M., Korytár Ľ., Kubátová A., Lehotská B., Lehotský R., Lučan R. K., Májek O., Matějů J., Řehák Z., Šafář J., Tájek P., Tkadlec E., Uhrin M., Wagner J., Weinfurtová D., Zima J., Zukal J. & Horáček I., 2010: Increasing incidence of Geomyces destructans fungus in bats from the Czech Republic and Slovakia. PlosONE, 5(11): 1–7 [e13853].
ŠpoutilF., Vlček V. & Horáček I., 2010: Enamel microarchitecture of a tribosphenic molar. Journal of Morphology, 271: 1204–1218.
Benda P., Abi-Said M., Bartonička T., Bilgin R., Faizolahi K., Lučan R. K., Nicolaou H., Reiter A., Shohdi W. M., Uhrin M. & Horáček I., 2011: Rousettus aegyptiacus (Pteropodidae) in the Palaearctic: list of records and revision of the distribution range. Vespertilio, 15: 3–36.
Evin A., Horáček I. & Hulva P., 2011: Phenotypic diversification and island evolution of pipistrelle bats (Pipistrellus pipistrellus group) in the Mediterranean region inferred from geometric morphometrics and molecular phylogenetics. Journal of Biogeography, 38: 2091–2105.
Jahelková H., Horáček I., 2011: Mating system of a migratory bat, Nathusius’pipistrelle (Pipistrellus nathusii) : different male strategies. Acta Chiropterologica, 13: 123-137. IF 1,129
Svoboda J., Bochenski Z. M., Čulíková V., Dohnalová A., Hladilová Š., Hložek M., Horáček I., Ivanov M., Králík M., Novák M., Pryor A. J. E., Sázelová S., Stevens R. E., Wilczynski J. & Wojtal P., 2011: Paleolithic hunting in a southern Moravian landscape: The case of Milovice IV, Czech Republic. Geoarchaeology, 26: 838–866.
Wagner J., Čermák S. & Horáček I., 2011: The presence of Ursus ex gr. minimus-thibetanus in the Late Villányian and its position among the Pliocene and Pleistocene black bears in Europe. Quaternaire, Hors-série, 4: 39–58.
Benda P., Vallo P., Hulva P. & Horáček I., 2012: The Egyptian fruit bat Rousettus aegyptiacus (Chiroptera: Pteropodidae) in the Palaearctic: Geographical variation and taxonomic status. Biologia, Bratislava, 67: 1230–1244.
Bilgin R., Gürün K., Maraci Ö., Furman A., Hulva P., Çoraman E., Lučan R. K., Bartonička T. & Horáček I., 2012: Syntopic occurrence in Turkey supports separate species status for Miniopterus schreibersii schrei­bersii and M. schreibersii pallidus (Mammalia: Chiroptera). Acta Chiropterologica, 14: 279–289.
Gregorovičová M., Zahradníček O., Tucker A. S., Velenský P. & Horáček I., 2012: Embryonic develop­ment of the monitor lizard, Varanus indicus. Amphibia-Reptilia, 33: 451–468.
Horáček I., 2012: Bílé nosy u nás aneb Druhý popis [White noses in our country or the Second description]. Vesmír, 91(11): 636–641 (in Czech).
Horáček I. & Špoutil F., 2012: Why tribosphenic? On variation and constraints in developmental dynamics of chiropteran molars. Pp.: 410–455. In: Gunnel G. F. & Simmons N. B. (eds.): Evolutionary History in Bats: Fossils, Molecules and Morphology. Cambridge Studies in Morphology and Molecules – New Paradigms in Evolutionary Biology. Cambridge University Press, Cambridge, xii+572 pp.
Soukup V., Horáček I., Černý R., 2012: Development and evolution of the vertebrate primary mouth. Journal of Anatomy
Hulva P., Marešová T., Dundarova H., Bilgin R., Benda P., Bartonička T. & Horáček I., 2012: Environ­mental margin and island evolution in Middle Eastern populations of the Egyptian fruit bat. Molecular Ecology, 21: 6104–6116.
Zahradníček O., Horáček I. Tucker A. S., 2012: Tooth development in a model reptile: functional and null generation teeth in the gecko Paroedura picta. Journal of Anatomy, 221: 195–208.
Horáček I., Knitlová M., Wagner J., Kordos L., Nadachowski A., 2013: Late Cenozoic history of Micromys (Mammalia, Rodentia) in Central Europe. PlosONE
Horáček I., Maul L.C., Smith K.T., Barkai R., Gopher A., 2013: Bat remains (Mammalia, Chiroptera) from the Middle Pleistocene site of Qesem Cave, Israel, with the first Pleistocene record of fruit bats in the Mediterranean region. Palaeontologia Electronica 16.3.23A
Horáček, I., Bartonička, T., & Lučan, R. K. (2014). Macroecological characteristics of bat geomycosis in the Czech Republic: results of five years of monitoring. Vespertilio, 17, 65-77.
BENDA, P., LUČAN, R. K., SHOHDI, W. M., PORTEŠ, M., & HORÁČEK, I. (2014). Microbats of the Western Oases of Egypt, Libyan Desert. Vespertilio, 17, 45-58.
UHRIN, M., BENDA, P., LUČAN, R., MIKOVÁ, E., RENDOŠ, M., & HORÁČEK, I. (2014). Noteworthy bat records from Romania. Vespertilio, 17, 197-213.
Juřičková, L., Ložek, V., Horáčková, J., Tlachač, P., & Horáček, I. (2014). Holocene succession and biogeographical importance of mollusc fauna in the Western Sudetes (Czech Republic). Quaternary international, 353, 210-224.
Hošek, J., Pokorný, P., Kubovčík, V., Horáček, I., Žáčková, P., Kadlec, J., ... & Bučkuliaková, S. (2014). Late glacial climatic and environmental changes in eastern-central Europe: Correlation of multiple biotic and abiotic proxies from the Lake Švarcenberk, Czech Republic. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 396, 155-172.
Lučan, R. K., Bartonička, T., Benda, P., Bilgin, R., Jedlička, P., Nicolaou, H., ... & Horáček, I. (2014). Reproductive seasonality of the Egyptian fruit bat (Rousettus aegyptiacus) at the northern limits of its distribution. Journal of Mammalogy, 95(5), 1036-1042.
Herdina, A. N., Kelly, D. A., Jahelková, H., Lina, P. H., Horáček, I., & Metscher, B. D. (2015). Testing hypotheses of bat baculum function with 3D models derived from microCT. Journal of Anatomy, 226(3), 229-235.
Svoboda, J., Hladilová, Š., Horáček, I., Kaiser, J., Králík, M., Novák, J., ... & Zikmund, T. (2015). Dolní Věstonice IIa: Gravettian microstratigraphy, environment, and the origin of baked clay production in Moravia. Quaternary international, 359, 195-210.
Häuselmann, P., Mihevc, A., Pruner, P., Horáček, I., Čermák, S., Hercman, H., ... & Bosák, P. (2015). Snežna jama (Slovenia): interdisciplinary dating of cave sediments and implication for landscape evolution. Geomorphology, 247, 10-24.
Řeřucha, Š., Bartonička, T., Jedlička, P., Čížek, M., Hlouša, O., Lučan, R., & Horáček, I. (2015). The BAARA (Biological AutomAted RAdiotracking) system: A new approach in ecological field studies. PloS one, 10(2), e0116785.
Herdina, A. N., Hulva, P., Horáček, I., Benda, P., Mayer, C., Hilgers, H., & Metscher, B. D. (2014). MicroCT imaging reveals morphometric baculum differences for discriminating the cryptic species Pipistrellus pipistrellus and P. pygmaeus. Acta chiropterologica, 16(1), 157-168.
Frick, W. F., Puechmaille, S. J., Hoyt, J. R., Nickel, B. A., Langwig, K. E., Foster, J. T., ... & Herzog, C. (2015). Disease alters macroecological patterns of North American bats. Global Ecology and Biogeography, 24(7), 741-749.
Kallistová, A., Skála, R., Horáček, I., Miyajima, N., & Malíková, R. (2015). Influence of sample preparation on the microstructure of tooth enamel apatite. Journal of Applied Crystallography, 48(3), 763-768.
Hošek, J., Hambach, U., Lisa, L., Grygar, T. M., Horáček, I., Meszner, S., & Knesl, I. (2015). An integrated rock-magnetic and geochemical approach to loess/paleosol sequences from Bohemia and Moravia (Czech Republic): implications for the Upper Pleistocene paleoenvironment in central Europe. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 418, 344-358.
Horáček I. (2015): Biodiverzita střední Evropy a kvartérní paleozoologie. Vesmír  94, 434 -439.
Horáček I. Ložek V., Knitlová M., Juřičková L. (2015): Darkness under candlestick: glacial refugia on mountain glaciers. Pp. 263-377 In: Sázelová S. et al. (eds.): Forgotten times and spaces. New perspectives in paleoanthropological, paleoethnological and archeological studies. CAS Inst. Archeology, Brno. 618 pp.
Horáček I., Bláha V., Wagner J., Čermák S., Žák K., Ryšánek K. (2016): Speleologie a výzkum kvartéru na Chlumu u Srbska: historie a současný  stav. Český kras,  Beroun, 42: 5-22.
Pyšková, K., Storch, D., Horáček, I., Kauzál, O., & Pyšek, P. (2016). Golden jackal (Canis aureus) in the Czech Republic: the first record of a live animal and its long-term persistence in the colonized habitat. ZooKeys, (641), 151.
Bilgin, R., Gürün, K., Rebelo, H., Puechmaille, S. J., Maracı, Ö., Presetnik, P., ... & Fressel, N. (2016). Circum-Mediterranean phylogeography of a bat coupled with past environmental niche modeling: A new paradigm for the recolonization of Europe?. Molecular phylogenetics and evolution, 99, 323-336.
Benda, P., Said, M. A., Jaoude, I. B., Karanouh, R., Lučan, R. K., Sadek, R., ... & Horáček, I. (2016). Bats (Mammalia: Chiroptera) of the Eastern Mediterranean and Middle East. Part 13. Review of distribution and ectoparasites of bats in Lebanon. Acta Soc. Zool. Bohem, 80, 207-316.
BENDA, P., KRUSKOP, S. V., & HORÁČEK, I. (2016). On the occurrence of Rhinolophus lepidus in West Turkestan: data from the Zoological Museum of the Moscow State University. Vespertilio, 18, 11-21.
Lučan, R. K., Bartonička, T., Jedlička, P., Řeřucha, Š., Šálek, M., Čížek, M., ... & Horáček, I. (2016). Spatial activity and feeding ecology of the endangered northern population of the Egyptian fruit bat (Rousettus aegyptiacus). Journal of Mammalogy, 97(3), 815-822.
Bartonička, T., Bandouchova, H., Berková, H., Blažek, J., Lučan, R., Horáček, I., ... & Zukal, J. (2017). Deeply torpid bats can change position without elevation of body temperature. Journal of thermal biology, 63, 119-123.

Kallistová, A., Horáček, I., Šlouf, M., Skála, R., & Fridrichová, M. (2017). Mammalian enamel maturation: Crystallographic changes prior to tooth eruption. PloS one, 12(2), e0171424.
Minarik, M., Stundl, J., Fabian, P., Jandzik, D., Metscher, B. D., Psenicka, M., Horáček, I. & Cerny, R. (2017). Pre-oral gut contributes to facial structures in non-teleost fishes. Nature, 547(7662), 209.
Horáček I., Sázelová S. (2017): Vertebarte fauna development in North Bohemian region during the Holocene. Pp. 35-48 in Svoboda J. (ed.) Mesolithic of Northern Bohemia II. Archeological Inst. AV CR Brno, 247 pp.
Knitlová, M., & Horáček, I. (2017). Late Pleistocene-Holocene paleobiogeography of the genus Apodemus in central Europe. PloS one, 12(3), e0173668.
Knitlová, M., & Horáček, I. (2017). Genus Apodemus in the Pleistocene of Central Europe: when did the extant taxa appear?. Fossil Imprint, 73(3-4), 460-481.
Kallistová, A., Skála, R., Šlouf, M., Čejchan, P., Matulková, I., & Horáček, I. (2018). Enamel apatite crystallinity significantly contributes to mammalian dental adaptations. Scientific reports, 8(1), 5544.
Svoboda, J., Pokorný, P., Horáček, I., Sázelová, S., Abraham, V., Divišová, M., ... & Šída, P. (2018). Late Glacial and Holocene sequences in rockshelters and adjacent wetlands of Northern Bohemia, Czech Republic: Correlation of environmental and archaeological records. Quaternary International, 465, 234-250.
Harazim, M., Horáček, I., Jakešová, L., Luermann, K., Moravec, J. C., Morgan, S., ... & Zukal, J. (2018). Natural selection in bats with historical exposure to white-nose syndrome. BMC Zoology, 3(1), 8.
Nejman, L., Lisá, L., Doláková, N., Horáček, I., Bajer, A., Novák, J., ... & Pacher, M. (2018). Cave deposits as a sedimentary trap for the Marine Isotope Stage 3 environmental record: The case study of Pod Hradem, Czech Republic. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology 497: 201-217.
Pyšková, K., Kauzál, O., Storch, D., Horáček, I., Pergl, J., & Pyšek, P. (2018). Carnivore distribution across habitats in a central-European landscape: a camera trap study. ZooKeys, (770), 227.
Kipson, M., Šálek, M., Lučan, R., Uhrin, M., Maxinová, E., Bartonika, T., ... & Naďo, L. (2018). Foraging Habitat, Home-Range Size and Diet of a Mediterranean Bat Species, Savi's Pipistrelle. Acta Chiropterologica, 20(2), 351-360.
Rofes, J., Cucchi, T., Hanot, P., Herman, J., Stephan, P., Cersoy, S., Horáček, I. & Zazzo, A. (2018). Postglacial recolonization and Holocene diversification of Crocidura suaveolens (Mammalia, Soricidae) on the north-western fringe of the European continent. Quaternary Science Reviews, 190, 1-10.
BENDA, P., SATTERFIELD, L., GÜCEL, S., HORÁČEK, I., LUČAN, R., CHARALAMBIDOU, I., & UHRIN, M. (2018). Distribution of bats in Northern Cyprus (Chiroptera). Lynx, series nova, 49.
Pokorny, R., Zak, K., Jurickova, L., & Horacek, I. (2018). Novy nalez kone (Equus ferus germanicus Nehring, 1804) ze svrchnepleistocennich sprasi ze Stradonic u Nizboru. Zpravy o geologickych vyzkumech, 5101, 25-3.
Stribna, T., Romportl, D., Demjanovič, J., Vogeler, A., Tschapka, M., Benda, P., Horacek, I. & Hulva, P. (2019). Pan African phylogeography and palaeodistribution of rousettine fruit bats: Ecogeographic correlation with Pleistocene climate vegetation cycles. Journal of Biogeography, 46(10), 2336-2349.
Svoboda, J., & Horáček, I. (2019). Between Bilzingleben and Vértésszölös: small-sized industries in the Middle Pleistocene of Europe (Czech Republic). Anthropologie, 57(3), 363-372.
Horáček, I. (2019). Family Rhinopomatidae (Mouse-tailed bats). pp. 164-177  In: Wilson D.E:  Mittermeier R.L. (eds.): Handbook of the Mammals of the World - Volume 9. Batsd. Lynx Edicion, Barcelona.
Horáček, I., Lehmann, T., Ruf, I., Krohmann, K., Maul, L.C. (2019). Gerhard Storch - a legend in mammals research. Fossil Imprint. 75: 5-21.
Horáček, I. & Trávníčková, E. (2019). Myotis gerhardstorchi sp.n. and comments on the European fossil record of Myotis frater group (Mammalia, Chiroptera). Fossil Imprint, 75(3-4), 315-342
Bachorec, E., Horáček, I., Hulva, P., Konečný, A., Lučan, R. K., Jedlička, P., ... & Bartonička, T. (2020). Spatial networks differ when food supply changes: Foraging strategy of Egyptian fruit bats. Plos one, 15(2), e0229110.
Bachorec, E., Horáček, I., Hulva, P., Konečný, A., Lučan, R. K., Jedlička, P., ... & Bartonička, T. (2020). Egyptian fruit bats do not preferentially roost with their relatives. Journal of Zoology, 312(2), 111-121.
Baca, M., Popović, D., Lemanik, A., Baca, K., Horáček, I., & Nadachowski, A. (2019). Highly divergent lineage of narrow-headed vole from the Late Pleistocene Europe. Scientific reports, 9(1), 1-10.
Hajna, N. Z., Bosák, P., Pruner, P., Mihevc, A., Hercman, H., & Horáček, I. (2020). Karst sediments in Slovenia: Plio-Quaternary multi-proxy records. Quaternary International, 546, 4-19.
Baca, M., Popović, D., Baca, K., Lemanik, A., Doan, K., Horáček, I., ... & Nadachowski, A. (2020). Diverse responses of common vole (Microtus arvalis) populations to Late Glacial and Early Holocene climate changes–Evidence from ancient DNA. Quaternary Science Reviews, 233, 106239.
Lučan, R. K., Reiter, A., Chytil, J., Horáček, I., & Bartonička, T. (2020). Pipistrellus kuhlii in the Czech Republic: 2007-2020 (Chiroptera: Vespertilionidae). Lynx, series nova, 51(1): .
Horáček, I. (2020). Obratlovci. pp. 124-127 In: Šída P. & Pokorný P. (eds.): Mezolit severních Čech III. Vývoj pravěké krajiny Českého ráje: Vegetace, fauna, lidé. Dolnověstonické studie 25, Archeologický ústav AV ČR, Brno. 600 pp.
Ptáková, M., Pokorný, P., Šída, P., Novák, J., Horáček, I., Juřičková, L., ... & Poschlod, P. (2020). From Mesolithic hunters to Iron Age herders: a unique record of woodland use from eastern central Europe (Czech Republic). Vegetation History and Archaeobotany, 30(2), 269-286
Riegert, J., Šindelář, J., Zárybnická, M., & Horáček, I. (2021). Large-scale spatial patterns of small-mammal communities in the Mediterranean region revealed by Barn owl diet. Scientific reports, 11(1), 1-16.
Bonilla-Salomón, I., Čermák, S., Luján, À. H., Horáček, I., Ivanov, M., & Sabol, M. (2021). Early Miocene small mammals from mwq1/2001 turtle joint (Mokrá-Quarry, South Moravia, Czech Republic): Biostratigraphical and palaeoecological considerations. Bull Geosci, 96(1), 99-122.
Hajna, N. Z., Mihevc, A., Bosak, P., Pruner, P., Hercman, H., Horáček, I., ... & Švara, A. (2021). Pliocene to Holocene chronostratigraphy and palaeoenvironmental records from cave sediments: Račiška pečina section (SW Slovenia). Quaternary International, 605, 5-24.
Žák K., Adamovič J., Horáček I., Čermák S., Wagner J., Eigner J., Mikysek P. (2022): Co ještě může přinést výzkum jeskyně Nad Kačákem v Českém krasu. – Nepublikovaná výzkumná zpráva, Geologický ústav AV ČR, v. v. i., 67 stran. Praha.
Horáček, I. (2022). From tribosphenic molar to dental phylotype of rodents. Abstr. TMD Štiřín.
Baca, M., Popović, D., Agadzhanyan, A. K., Baca, K., Conard, N. J., Fewlass, H., ...Horacek, I.  & Nadachowski, A. (2023). Ancient DNA of narrow-headed vole reveal common features of the Late Pleistocene population dynamics in cold-adapted small mammals. Proceedings of the Royal Society B, 290(1993), 20222238.
Arbez, L., Tereza, H., Royer, A., Sophie, M., & Ivan, H. (2023). The wood lemming and the development of taiga in Late Pleistocene Central Europe. Quaternary Science Reviews, 303, 107974.
Horáček, I., Hadravová, T., Čermák, S. & Žák, K. Pleistocenní fauna z Kubrychtovy jeskyně v Tetíně v Českém krasu. Český kras 48: 18-22.
Horáček, I. & Lebedová, K. (2022).  Cricetinae in the Quaternary fossil record of the Czech Republic and Slovakia (Rodentia: Cricetidae).   Lynx, n. s. (Praha), 53: 365–41
Horáček, I. & Benda, P. (2023). Vladimír Hanák (1931-2022). Journal of Mammalogy  (3): 1-3.
Benda, P., Ševčík, M., Horáček, I., Uvizl, M., Reiter, A., & Uhrin, M. (2024). Bats (Mammalia: Chiroptera) of the Eastern Mediterranean and Middle East. Part 17. New records of bats and their ectoparasites from Tajikistan with a review of these faunas of the country including a description of a new species of horseshoe bat. Acta Soc. Zool. Bohem, 88, 1-213.
Hošek, J., Pokorný, P., Storch, D., Kvaček, J., Havig, J., Novák, J., ... & Horáček, I. (2024). Hot spring oases in the periglacial desert as the Last Glacial Maximum refugia for temperate trees in Central Europe. Science Advances, 10(22), eado6611.
Pažitková, B., & Horáček, I. (2024). Shrews of tribe Nectogalini (Mammalia, Eulipotyphla, Soricidae) in the fossil record of the Czech Republic and Slovakia. Fossil Imprint, 190-228.
Baca, M., Popović, D., Lemanik, A., Bañuls‐Cardona, S., Conard, N. J., Cuenca‐Bescós, G., ... & Nadachowski, A. (2023). Ancient DNA reveals interstadials as a driver of common vole population dynamics during the last glacial period. Journal of biogeography, 50(1), 183-196.
Arbez, L., Hadravova, T. Royer, A., Mointure, S., Fejfar, O., Horáček, I. (2024). Re-investigation of fossil Lemmini specimens from the early and middle Pleistocene of Western and Central Europe: Evolutionary and paleoenvironmental implications. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 641, 112128.
Staňková, M., Lučan, R., & Horáček, I. (2023). Clustering behaviour and acoustic activity of Myotis myotis (Mammalia: Chiroptera) in an undergroung hibernaculum. Acta Soc. Zool. Bohem, 87,

(d) Učebnice

Anděra, M., I.Horáček, 1982: Poznáváme naše savce. Mladá Fronta, Praha, 254 pp.
Ložek, V., I.Horáček, 1980: Jeskynní výplně. Stalagmit, Praha, Suppl.1980,1: 1-26
Bosák,P., J.Demek, I.Horáček, 1981: Fosilní kras. Stalagmit, Praha, Suppl. 1981: 1-19.
Horáček, I., 1985: Létající savci. Academia, Praha, 155 pp.
Horáček, I. 2003: Biogeografie. Biodiversita. Pp. 681-698 In: Rozsypal et al.: Biologie 2000. Scientia, Praha. 797 pp.
Smrž J., Horáček I., Švátora M., 2004: Biologie živočichů. Fortuna, Praha.

(f) Přednášky typu "invited speaker"

Horáček, I., 1982: Biostratigraphic dating in the fossil karst. Annual meeting Polish Speleol. Society, Ojcow
Horáček I., 1989: Rates of Quaternary evolution in mid-European small mammals: what caused the differences, Symp. Mammalian Evol. Paleoecology. 5th ITC Rome
Horáček, I.,  1992: Functional morphology of shrews in fossil record, Inst. Anatomy, Univ. Frankfurt a.M. - seminární přednáška
Horáček, I., 1998: The Carpathian System and chiropteran biogeography.  2nd Symp. Bats Carpathians, N.Sedlice 1998 - úvodní přednáška symposia
Horáček, I.,  Gaisler, J., Hanák, V., 2000: The Bats of the Palearctic Region: a taxonomic, ecological and  biogeographic review.  8th European Bat Research Symposium, Krakow - úvodní přenáška symposia
Horáček I., Ložek V., Fejfar O., 2004: Mid-Pleistocene Revolution in Mid-European fossil record. 18th Senckenberg Conf. :  Paleoecology of Neogene and Quaternary. Weimar 2004.
Horáček I., 2004: Biostratigraphic dating of cave deposits. Symp. Dating cave deposits. Postojna 2004.
Horáček I. a ČESON, 2004:  Současné změny středoevropské fauny prismatem výsledků nejrozsáhléjší monitorovací akce v ČR. Úvodní přednáška symp. Zoologické dny 2004, Brno.
Horáček I., 2004: Concluding remarks.  Workshop on Holocene Mammalian paleobiography, Leiden.
Horáček, I., 2007:  Time and Karst: a biostratigraphic perspective. Acta Carsologica 36: 219-220.
Horáček I., 2007:  Developmental dynamics of chiropteran molars: on variation and constraints. Symposium Evolution of bats. Austin, USA, JVP 27 (3): 91A

(j) Disertační, rigorosní a habilitační práce

Horáček, I., 1976: Populační ekologie netopýra velkého, Myotis myotis (Borkhausen, 1797) ve středních Čechách. Dipl. a rigor. (MSc.)  PřF UK Praha, 205+447 pp.
Horáček, I., 1984: Paleoekologický význam drobných savců (Insectivora, Chiroptera, Rodentia) v kvartéru ČSSR. CSc./PhD disertace ÚGG ČSAV Praha, 255 pp.
Horáček, I., 1994: Aspekty biogeografického výzkumu středoevropských savců. Habilitační práce, PrF UK Praha, 70+1130 pp.

(k) Abstrakty nepublikovaných symposiálních sdělení  (výběr)

Horáček I., Zima J., 1978: Convergent trends in the evolutioon of vespertilionid bats. Abstr. 2nd Int.Theriol.Congress, Brno, p. 184
Horáček I., 1978: Social organisation in Myotis myotis (Chiroptera). Abstr. 2nd Int.Theriol. Congress, Brno, p. 190
Horáček I., 1989: Rates of Quaternary evolution in mid-European small mammals: what caused the differences, Symp. Mammalian Evol. Paleoecology. 5th ITC Rome
Horáček I., 1991: Community dynamics vs. life traits pattern in response to the environmental fluctuations. Abstr. 4th Congress Eur.Evol.Biol., Debrecen, p.
Horáček I.,  1993: Survey of the Neogene bats in Czech and Slovak Republics. Abstr. 63.Jahrestag. Paläont. Ges., Prag, p. 54
Horáček I., 1993: Climate-dependent changes in the Mid-European mammalian Quaternary record. Abstr. ESF Workshop Influence of Climate on faunal evolution. Sant Felieu de Guixols, p. 28
Horáček, I., 1993: Early history of vespertilionid bats .Bat Res. News, N.Y., :
Horáček I., 1994: Holocene development of the mammalian  community structure as revealed of the Mid-European fossil  record. Z.Säugetierk. 59, Sonderheft (Abstr.): 21.
Horáček I., Benda P., 1994: The patterns of morphometric  variation in three Myotis spp. in Central Europe and in the  Mediterranean region. Z.Säugetierk. 59, Sonderheft (Abstr.):  21-22.
Horáček I., 1994: A revised view of the Mid-European mammalian biostratigraphy around Mn17/Q1 and Q2/Q3 boundaries. Abstr. Conf. Neogene and Quaternary Mammals of the Palearctic, Krakow, p. 31
Horáček I., 1995: Late Vistulian/Early Holocene faunal  interchange in Central Europe and in the E-Mediterranean. ERC The Ecological Setting of Europe, La Londes les Maures,  Abstr. p.58
Horáček I., 1995: Late Vistulian/Early Holocene faunal  interchange in Central Europe and in the E-Mediterranean. ERC The Ecological Setting of Europe, La Londes les Maures,  Abstr. p.58
Horáček, I., 1996: Structural changes in mammalian communitie around the MN17/Q1 and Q2/Q3 boundaries: a comparison based on Central European record. Abstr. INQUA-SEQS Congr. The Dawn of the Quaternary, Kerkrade, p. 45.
Horáček, I., 1996: Holocene history of the Mid-European bat communities. Abstr.7th EBRS, Veldhoven,  p.26.
Horáček, I., J.Zima, 1996: Evolutionary divergence in the Lesser Horseshoe bat. ibid. p. 27
Němec, P. , I.Horáček, 1996: Chiropteran diphyly - definitely a past question? ibid. p. 51
Horáček, I., 1996: Holocene paleobiogeography of dormice in Central Europe.  3rd Int.Conf.Dormice, Zagreb.
Horáček, I. , Hanák, V., Benda, P., 1998:  Bats (Chiroptera) of the Eastern Mediterranean: a biogeographic summary. Z.Saugetierk., 63, Suppl-:  26.
Horáček, I., Ringel, T., 1998: Late Pleistocene and Holocene morphometric changes in Arvicola terrestris (Rodentia: Arvicolidae) in Central Europe. ibid:  27
Weinfurtová, D., Horáček, I., 1998: Clustering behaviour and thermal strategy in a breeding colony of Myotis myotis (Chiroptera: Vespertilionidae).  ibid.:  67.
Horáček, I., 1998: Biogeografie mladočtvrtohorní faunogenese středoevropské savčí fauny.  Abstr. Zoologické dny Brno
Benda, P., Horáček, I., 1998:  Bats of the genus Myotis in Turkey (Chiroptera, Vespertilionidae). Abstr. Euro-Am. Mammal Congress, Santiago di Compostela 1998.
Horáček, I., 1998:  Late Pleistocene mammalian palaeobiogeography of Central Europe. ibid.
Horáček, I,  1998: The Carpathian System and chiropteran biogeography.  2nd Symp. Bats Carpathians, N.Sedlice 1998.
Horáček, I., 1998: Biogeografie mladočtvrtohorní faunogenese středoevropské savčí fauny.  Abstr. Zoologické dny Brno
Benda, P., Horáček, I., 1998:  Bats of the genus Myotis in Turkey (Chiroptera, Vespertilionidae). Abstr. Euro-Am. Mammal Congress, Santiago di Compostela 1998.
Horáček, I., 1998:  Late Pleistocene mammalian palaeobiogeography of Central Europe. ibid.
Horáček, I,  1998: The Carpathian System and chiropteran biogeography.  2nd Symp. Bats Carpathians, N.Sedlice 1998.
Němec, P., H. Koudelková, R.Druga and I. Horáček, 2000: Structure of the Chiropteran Spinal Cord: Implications for the Phylogenetic Systematics. J. Morphol. 248: 266.
Horáček I., 2002:  Early Myotis: comment on fossil record. IXth European Bat Research Symposium, August 26–30, 2002, LeHavre.
Němec, P., Lucová M., Horáček I., 2002: Neuromorphological traits and phylogeny of bats. IXth European Bat Research Symposium, August 26–30, 2002, LeHavre.
Horáček I. et al., 2002:  Monitoring bats in underground hibernacula of Czech Republic: 33 year of study. IXth European Bat Research Symposium, August 26–30, 2002, LeHavre.
Hulva, P. and Horáček, I., 2002: Mega- and Microchiroptera: old clades and new views. IXth European Bat Research Symposium, August 26–30, 2002, LeHavre.
Hulva, P., Horáček, I., 2002: Micro- vs. Megachiroptera: molekulární evidence, Zoologické dny, 2002, Brno
Horáček I, 2002: Tatry v době ledové: mrazová pustina? Kvartér 2002, Brno.
Hulva, P., Horáček, I., Řehák, Z., 2003: Genetic diversity and distribution of of Pipistrellus pipistrellus and P. pygmaeus. 4th European Congress of Mammalogy, July 27 – August 1, 2003, Brno.
I. Horáček, 2003: Late Pleistocene – Holocene development of mammalian communities in Central and SE Europe: is the ORD model valid? 4th European Congress of Mammalogy, July 27 – August 1, 2003, Brno.
Černý R., Horáček I.. 2004: Neural crest cell condenstations and jaw cartilage morphogenesis: A speculative perspective of development and evolution.  COST B23 WG1-3 Meeting, Ghent, 19-20 March 2004, Abstr. P. 2
Copková H., Horáček I., 2004:  Hraboš polní: fosilní záznam a fylogenetická historie. Konf. 10.Kvartrér 2004, Brno 2.12.2004, Abstr. P.
Horáček I., Špoutil F.. 2004: Dental phenotype in vespertilionid bats: a comment on variation and constraints. COST B23 WG1-3 Meeting, Ghent, 19-20 March 2004, Abstr. P.6
Horáček I. a Špoutil F., 2004:  Tribosphenic molar: developmental architecture of its enamel coat. 9th Congress Teeth morphogenesis and development. York 19-22 July 2004
Horáček I., Špoutil F., 2004: Why tribosphenic? On mystery of chiropteran teeth. 13th International Bat Research Conference, Mikolajki, Poland, 23-27 August 2004,  Abstracts p.35
Němec P., M.Lucová, H.Skálová, I.Horáček, 2004: Bearing of neuromorphological traits on reconstruction of chiropteran phylogeny. Ibid., p.17
Špoutil F., Horáček I., 2004:  Enamel patterns in tribosphenic molar.  COST B23 WG4 Meeting, Debrecen, October 2004, Abstr. P.
Horáček, I. Fejfar, O., Ložek V., 2004:  Middle Pleistocene revolution in Mid-European Fossil Record. Abtr. 18th Senckenberg Conference on Cenozoic Paleoecology. Weimar .
Horáček, I., 2004 : Biostratigraphic dating of cave sediments. Abstr. Symp. Dating cave sediments. Postojna, Sl.
 Horáček, Spoutil, F., Vrabcová S., 2006: Why tribosphenic.   p.42  In: Heikinheimo, K. and Thesleff, I. (eds).: Abstr. COST B23 Joint Meeting, Helsinki. 108 pp.
Horáček, I., Suvova, Z., Krejcova, D., Copková, H., 2006: Structure of dental phenotype in arvicolid rodents: adaptive variations and constraints. p. 43 In: Heikinheimo, K. and Thesleff, I. (eds).: Abstr. COST B23 Joint Meeting, Helsinki. 108 pp
Zahradníček, O., Horáček, I., 2006: Geckos teeth: an alternative model of amniote tooth-cusps formation? p. 58 In: Heikinheimo, K. and Thesleff, I. (eds).: Abstr. COST B23 Joint Meeting, Helsinki. 108 pp
Horáček, I., Špoutil F., Vrabcová, S., 2006: Genetic signalling or contextual control? Regulation dynamics in development of mammalian dentitions. p. 116  In: Černý, R., Horáček, I., Galis, F. (eds): The First and Founding meeting of the European Society for Evolutionary Developmental Biology
Horacek I., 2007: Biogeography of the Later-Pleistocene-Holocene faunal transition in central Europe.  p. 540   In: Prigioni C, Sforzi A. (eds.): Abstracts V European Congress of Mammalogy. Hystrix  It.J.Mammalogy n.s. 1-2: 1-576.
Horacek I., Benda P., Hulva P., Lucan R., HAnak V., 2007: Batsof the Eastern Mediterranean:the geographic structure of diversity and its sources. p. 211 In: Prigioni C, Sforzi A. (eds.): Abstracts V European Congress of Mammalogy. Hystrix  It.J.Mammalogy n.s. 1-2: 1-576.
Horacek I., Spoutil F., Vrabcova S., 2007: Odontogenesis of tribosphenic molars: developmental background of a major mammalian apomorphy. p. 57   In: Abstracts 8th ICVM Paris.  172 pp.
Soukup V., Epperlein H.H., Horacek I., Cerny R., 2007: Oral morphogenesis in axolotl and the first evidence of endodermal teeth for gnathostomes.  p. 120 In: Abstracts 8th ICVM Paris.  172 pp.
Drozd B., Cerny R., Svatora M., Horacek I., 2007:  Pharyngeal dentition in asp: from harmless asp's baby to the freshwater beast. p. 34 In: Abstracts 8th ICVM Paris.  172pp.
Zahradnicek O., Horacek I., 2007: Bicuspid teeth of a gecko, Paroedura pictus: ontogeny of cusp formation. p. 140 In: Abstracts 8th ICVM Paris.  172 pp.
Hulva P., Benda P., Hanák V., Horáček I., 2007: A new lineage in the Pipistrellus pipistrellus complex from Europe (Crete, Greece). Abstracts 14th International Bat Research Conference, Merida
Horacek I., Hulva P., Lucan R.K., Havelkova S., Benda P., 2007: On flyiing foxes in the Mediterranean region. Abstracts 14th International Bat Research Conference, Merida
Horáček I., Benda P., Storch D., HulvaP., Lucan R., 2007: Bat fauna of the Eastern MEditerranean: historical biogeogrphy vs. macroecological explanations. Abstracts 14th International Bat Research Conference, Merida

(l) Nepublikované závěrečné zprávy a závěrečné zprávy grantových projektů

Horáček, I., 1970: Poznámky k ekologii a faunistice netopýrů v ČSSR. 62 pp. (uloženo v Kat.zool. PřF UK.)
Horáček, I., 1975: Myotis nattereri (Kuhl, 1818) v ČSSR a poznámky o fosilních formách podrodu Isotus Kolenati, 1856 (Mammalia, Chiroprtera ). 124 pp.  SVOČ PřF UK.
Ložek, V., I.Horáček, 1980: Zpráva o výzkumu kvartérních společenstev v letech 1976-1980.ÚGG ČSAV Praha. 37 pp.
Horáček, I., 1980: Nálezy mladocenozoických obratlovců v Českém krasu a jejich význam pro poznání morfogenese této oblasti. ÚGG ČSAV Praha. 31 pp.
Horáček, I., 1981: A revised list of the chiropteran collection of the locality Gundersheim (Rheinhessen) and report on its investigation. Inst.Paläont. Univ. Erlangen-Nürnberg. 24 pp.
Horáček, I., 1982: Stratigrafické aspekty nových nálezů Plio-Pleistocenní fauny v ČSSR. ÚGG ČSAV Praha, 20pp.
Horáček, I., 1983: Kritický katalog fosilních letounů Evropy a severní Afriky (Mammalia, Chiroptera). Práce ke kand. minimu, ÚGG ČSAV Praha, 88 pp.
Ložek, V., I.Horáček, 1983: Postglaciální sledy měkkýšů a obratlovců ve vzájemné korelaci. ÚGG ČSAV Praha, 60 pp.
Horáček, I., 1985: Ekologické změny savčích společenstev v průběhu kvartérního klimatického cyklu. ÚGG ČSAV Praha, 27 pp.
Horáček, I., J.Zima, 1995: PV 408/1994/VŠAV : Drobní savci v materiálu středoasijských expedic UK a AV. Záv.zpráva 1994: 45 pp. Praha.
Horáček, I., M.Macholán, J.Zima, V.Vohralík, P.Benda, D.Frynta, V.Hanák, L.Lukáčová, 1995: GAČR 206/93/0531: Evoluční vztahy savců střední Evropy a středozemní oblasti: multidisciplinární přístup. Záv.zpráva 1995: 88 pp. Praha
Horáček, I., 1998: Postglaciální vývoj středoevropské savčí fauny. GAUK 70/95 . Záv. zpráva 1998: 75 pp. Praha
Horáček, I., P.Němec., 2000: Mícha u netopýrů: srovnávací, fylogenetická a funkční analysa. GAUK 263/1997 B. Záv. zpráva 2000: 33 pp. Praha
Horáček, I., 2001: Sociální biologie netopýrů: srovnávací a vývojové souvislosti. GAUK 97/1998/ B. Záv. zpráva 2001: 102 pp. Praha
Řehák, Z., Horáček I.: Situace Pipistrellus pipistrellus superspecies v České republice. GAČR 206/02/0961 - 2002

(m) Ostatní publikace

m1: Popularisační články, recense aj.

Horáček, I., J.Hošek, 1981-1982: Savci v naší přírodě - seriál 10 článků. Naší přírodou, Praha, 1(1)-2(2) - ca 30 pp. celkem
Horáček, I., 1982: Hanák,V., V.Mazák: The illustrated encyclopaedia of mammals. Lynx, Praha, 21: 152-153.
Horáček, I., 1983: Metodické poznámky k ochraně netopýrů. Metodická příručka ČSOP, Praha, 4. 81-95.
Horáček, I., 1985: Vojen Ložek - 60 years. Věstník ÚÚG, Praha,
Horáček, I., 1985: Etologie. pp. In: Informatorium živé přírody. Nakl. Mladá Fronta, Praha.
Horáček, I., 1986: Plachtící savci. Živa,
Horáček, I., 1989: Ježek, myslivost a ekologie. Myslivost,
Horáček, I., 1991: Netopýři. pp. In: Metodika ochrany přírody. ČSOP Praha.
Horáček, I., 1991: Myotis. Lynx, Praha,
Horáček, I., V.Vohralík, 1992: Vladimír Hanák - a sexagenarian. pp. 12-21. In: Horáček, I., V.Vohralík (eds.): Prague Studies in Mammalogy, Karolinum, Praha.
Horáček, I., 1993: Nomenklatura evropských netopýrů. Bulletin ČESON, 2:
Horáček, I., 1998: Wojcik JM & Wolsan M (eds), 1998: Evolution of Shrews. (recense) Acta Soc.Zool.Bohem, 62: 314.
Horáček, I. J.Mlíkovský, 2001:  Focus on fossil mammals: life story of Oldřich Fejfar, Lynx 32: 3-35.
Horáček, I.,  D.Frynta, 2003: Prof.RNDr. Zdeněk Veselovský – 75 let. Lynx 34: 229-232.
Horáček, I., V.Ložek, 2004: Ledová doba z pohledu zoologa. I: Glaciální fauina a historie její výpovědi. Živa 2004 (1): 5-9.
Ložek V., I.Horáček, 2004: Ledová doba z pohledu zoologa II. Živa 2004 (2): 51-55.

Horáček I., 2005: Kemp T.S.  2005: The Origin and Evolution of Mammals. Book review. Lynx N.S: 36: 140.
Horáček I., 2006: Mickoleit G.:Phylogenetische Systematik der Wirbeltiere. Book review. Acta Soc.Zool.Bohem. 70: 331-332.

Benda P., I.Horáček 2007: "Naši plši" šedesátiletí: k jubileu Miloše Anděry a Vladimíra Vohralíka. Lynx (Praha), n.s., 38: 145-149.

m2: Překlady

Horáček, I. (transl.), 1992: M.Chinery: Jedovatí živočichové. Nakl.OP Praha
Horáček, I., Z.Storchová (transl.), 1993: L.Gamlin: Evoluce. Nakl.OP Praha 64 pp.
Horáček, I. (transl.), 1995: Savci, Chiroptera, Evoluce in  Encyklopedia Obratlovci. Nakl. OP Praha, pp.
Horáček, I., J.Hošek (transl.), 1996: Zázrak života. Nakl.OP Praha.
Horáček, I. (transl.), 1999: T.Pinkson: Květy Wiricuty. Volvox Globator, Praha.

m3: Eseje

Horáček, I., 1982: Jazyk očima biologa. Doslov ke knize J.N.Panova: Znaky,symboly. jazyky. Nakl. Panorama.
Horáček, I., 1992 : O singularitách a diskusích s nimi spojených. Vesmír,  
Horáček, I., 1993: O komunikaci, prostředcích a cílích. Analogon  12:
Horáček, I., 1994: Rub života. pp. 119-213  In: Z.Kratochvíl: Filosofie živé přírody. Herrmann a synové Praha.
Horáček, I.,  1994: O kumunikaci, prostředcích a cílích. Analogon 14: 47-50
Horáček, I.,  1995: Věda (o životě) a čas. Analogon, 13: 11-17.
Horáček, I.,  1995: Obraz člověka. Analogon 14: 6-7.
Horáček, I., 1995: O myškách profesora Burdy, tabu incestu a podobných nočních můrách. Vesmír
Horáček, I., 1995:  Zabít hada. Analogon 15: 55-58
Horáček, I., 1995:  Interface s netopýrem. Analogon 15:
Horáček, I., 1995:  O ekologii. Analogon 15: 70-73
Horáček, I., 1996:  O ekologii, ekonomech a nepřátelích společnosti. Analogon 17: 96
Horáček, I., 1996:  O vědeckém tvoření, mravnosti a nemravnosti. Analogon, 17: 72-73
Horáček, I.,  Vlčková L., 1996:  Město: prostor slasti a topologie žaláře. Analogon 18: 96-99.
Horáček, I., 1996:  Spiklenci slasti. Analogon 18: 130.
Horáček, I., 1996:  Otevřený dopis Národní galerii. Analogon 18: 130-131
Horáček, I., 1997:  Mentální morfologie. Analogon 19: 42-45.
Horáček, I., 1997:  Za principem analogie. Analogon 20:
Horáček, I., 1997:  Lesk a bída Nového věku (New Age). Analogon 20:
Horáček, I., 1998:  Dynamika rituálu. Analogon 21:
Horáček, I., 1998:  Parakabinet Evy a Jana Švankmajerových. Analogon 21:
Horáček, I., 1998:  Koloseum. Analogon 23: 23-25.
Horáček, I., 1998:  O hudbě. Analogon 23: 54-55.
Horáček, I., 1998:  Náhoda a chaos: včera, dnes a zítra. Analogon 24: 2
Horáček, I., 1999:  Doslov. In: T.Pinkston: Květy Wiricuty. Volvox Globator Praha.
Horáček, I., 1999:  Nad obludnostmi milenia. Analogon 25: 40
Horáček, I., 1999:  Hlavou dolů. Vesmír, :
Horáček, I., 2000:  Věc Mikropulos: mrtví prd ví. Analogon 28: 12-13
Horáček, I., 2000:  Revolta a tradice. Analogon 30: 5         
Horáček, I., 2001:  Obraz nepřítele. Analogon 32: 45-51
Zrzavý J., I.Horáček, 2005: Emajlová rozprava o násilí a zabíjení. Analogon 41:

Černý R., Horáček I. & Galis F. (eds), 2006: The First and Founding meeting of the European Society for Evolutionary Developmental Biology, Prague, August 2006 – Proc.Abstracts. Charles Univerity, Praha, 364 pp.
Čermák S., Wagner J., Fejfar O., Horáček I., 2007: New Pliocene localities with micromammals from the Czech Republic: a preliminary report. Fossil Record 10: 60-68.
Horáček I., 2007: Holocene history of the mammalian fauna in the Northern Bohemian sandstone region (Czech Republic), pp. 265-272 In:  Sandstone Landscapes. Academia, Praha.
Horáček I., Mihevc A., Zupan Hajna N., Pruner P., Bosák P., 2007: Fossil  vertebrates and paleomagnetism update of  one of the earlier stages of cave evolution in the classical karst, Slovenia: Pliocene of Črnotiče II site and Račiška pečina. Acta Carsologica 36: 111-128.
Sabol M., Fejfar O., Horáček I., Čermák S., 2007: The Early Miocene micromammalian assemblage from Mokrá - 1/2001 Turtle Joint site (Moravia, Czech Republic) - preliminary results. Scripta. Fac.Sci.Nat.Uni.Masaryk, Brno, 36: 57-64.
Ložek V., Horáček I., 2007: Molluscan and vertebrate successions from the Velká Ružínská Cave (East Slovakia).  pp. 217-225  In: Festschrift fur Klaus Dietrich Jaeger  zum 70 Geburtstag. Terra Prehistorica
Svoboda J., Hajnalová M., Horáček I., Novák M., Přichystal A., Šajnerová A., Yaroschevich A., 2007: Mesolithic settlement and activities in rockshelters of the Kamenice river canyon, Czech Republic. Eurasian Prehistory 5: 65-127.
Svoboda J.A., Hajnalova M., Horáček I., Novák M., Přichystal A., Šajnerová A.,. 2007: Okrouhlík. Výzkum mezolitického sídelního areálu v soutěsce Kamenice v roce 2005.  Minulost Českého Švýcarska V: 5-37.
Horáček I., 2007:  Developmental dynamics of chiropteran molars: on variation and constraints. JVP 27 (3): 91A
Landová E., Horáček I., Frynta D., 2006: Have black rats evolved a culturally-transmitted techniques of pinecone opening independently in Cyprus and Israel?  Israel J. Ecol. Evolution, 52: 151-158.
Benda P., Hanák V., Horáček I., Hulva P., Lučan R. & Ruedi M., 2007: Bats (Mammalia: Chiroptera) of the Eastern Mediterranean. Part 5. Bat fauna of Cyprus: review of records with confirmation of six species new for the island and description of a new subspecies. Acta Societatis Zoologicae Bohemicae, 71: 71–130.
Hulva P., Benda P., Hanák, Evin A. & Horáček I., 2007: New mitochondrial lineages within the Pipistrellus pipistrellus complex from Mediterranean Europe. Folia Zoologica, 56: 378–388.
Dreslerová D., Horáček I., Pokorný P., 2007: Přírodní prostředí Čech a jeho vývoj. pp. 23-50 In: Kuna M. (ed.): Archeologie pravěkých Čech 1. Pravěký svět a jeho poznání. ArÚ AV ČR Praha 163 pp.
Hulva P., Horáček I. & Benda P., 2007: Molecules, morphometrics and new fossils provide an integrated view of the evolutionary history of Rhinopomatidae (Mammalia: Chiroptera). BioMedCentral Evolutionary Biology, 7: 165.
Jahelková H., Horáček I,, Bartonička T., 2008: The advertisement song of Pipistrellus nathusii (Chiroptera, Vespertilionidae): a complex message containing acoustic signatures of individuals. Acta Chiropterologica 10: 103-126.
Soukup V., Epperlein H-H., Horáček I, Černý R., 2008: Dual epithelial origin of vertebrate oral teeth. Nature. 455:795-798  / doi: 10.1038/nature/07304.
Horáček I., 2008: Jak se zviřátka rozkmotřila a co z toho pošlo. pp. 63-76 In: Pokorný P., Bárta M. (eds.): Něco překrásného se končí – Kolapsy v přírodě a společnosti. Nakl. Dokořán, Praha, 255 pp.
Horáček I., 2008: K fotografii na frontispisu - epilog. pp.251-252  pp. 63-76 In: Pokorný P., Bárta M. (eds.): Něco překrásného se končí – Kolapsy v přírodě a společnosti. Nakl. Dokořán, Praha, 255 pp.
Zahradnicek O., Horacek I., Tucker A.S., 2008: Viperous fangs: development and evolution of the venom canal. Mechanisms of Development, 125: 786-796.   IF  3,160
Lucan R., AndreasM., Benda P., Bartonička T., Březinová T., Hoffmanová, A., Hulová Š., Neckářová J., Reiter A., Svačina T., Šálek M., Horáček I., 2009: Alcathoe bat (Myotis alcathoe) in the Czech Republic: distributional status, roosting and feeding ecology. Acta Chiropterologica. 11:  61-69.             IF  1,129
Spoutil F., Vlcek V., Horáček I., 2010: Enamel Microarchitecture of a Tribosphenic Molar. Journal of Morphology, 271: 1204 - 1218.   IF 2,087
Martinkova N. Bačkor P., Bartonička T. … Jahelková H., …Lučan R.K., …Zima J., Horáček I., 2010: Increasing incidence of Geomyces destructans Fungus in Bats from the Czech Republic and Slovakia. PlosONE, 5/11: e13853: 1-7.  IF  4,610
Lucan R. K., Hanák V. & Horáček I., 2009:  Long-term re-use of tree roosts by European forest bats. Forest Ecology and Management, 258, 1301-1306.  IF 2,507
Královič M., Horáček I., Černý R., 2010:  Mouth development in the Senegal bichir Polypterus senegalus does not involve the oropharyngeal membrane: possible implications for the ecto-endoderm boundary and tooth initiation. Journal of Applied Ichthyology, 26, 179-182. IF 1,117
Horáček, I., P. Benda, R. Sadek, S. Karkabi, M. Abi-Said, R. Lučan, P. Hulva, and R. Karanouh. 2008. Bats of Lebanon. State of knowledge and perspectives. Al-Ouat’Ouate, Revue Libanaise de Speleologie et de Karstologie, N. S., 14: 52–67.
Horáček, I., P. Benda, R. Sadek, S. Karkabi, M. Abi-Said, R. Lučan, M. Uhrin, I. Bou Jaoude, R. Karanouh, and S. Akil. 2009. Bat census in Lebanese caves in 2008 & 2009. Al-Ouat’Ouate, Revue Libanaise de Speleologie et de Karstologie, N. S., 15: 70–73.
Benda P., Georgiakakis P., Dietz C., Hanák V., Galanaki K., Markantonatou V., Chudárková A., Hulva P. & Horáček I., 2009: Bats (Mammalia: Chiroptera) of
the Eastern Mediterranean and Middle East. Part 7. The bat fauna of Crete, Greece. Acta Societatis zoologicae bohemicae [Praha], 72: 105–190.
Hanák V., Neckářová J., Benda P., Hanza l V., Anděra M., Horáček I., Jah elková H., Zieglerová A. & Zieglerová D., 2009: Bat fauna of Prague: review of records with notes on the urban populations. Natura Pragensis [Praha], 19: 3–89.
Kučera J., Sůvová Z., Horáček I., 2009: Stránská skála jeskyně: glacialní společenstvo hlodavců (Rodentia) ze staršího středního pleistocenu. Lynx n.s., 40: 43-69.
Čermák S., Wagner, J., Morávek, R., Fejfar, O., Horáček, I., 2010: Pliocenní fauna obratlovců z krasových výplní vápencového lomu ve Vitošově na severní Moravě. Zprávy Vlastivědného muzea v Olomouci, 299, s. 20–36.
Horáček, I., Benda P. (eds.), 2010: 15thIBRC – the Conference Manual.  Abstracts of the 15th International Bat Research Conference, Prague 23-27 August 2010.  380 pp.
Horáček I., Uhrin M. (eds.), 2010: A tribute to bats. Lesnická práce, Kostelec, 400 pp.
Hanák V., Anděra M., Uhrin M., Danko Š. & Horáček I., 2010: Bats of the Czech Republic and Slovakia: distributional status of individual species. Pp.: 143–254. In: Horáček I. & Uhrin M. (eds.): A Tribute to Bats. Lesnická práce, Kostelec nad Černými lesy, 400 pp.
Horáček I., 2010: Monitoring bats in underground hibernacula. Pp.: 93–108. In: Horáček I. & Uhrin M. (eds): A Tribute to Bats. Lesnická práce s.r.o., Kostelec nad Černými lesy, 400 pp.
Horáček I., 2010: … until now. Pp.: 31–39. In: Horáček I. & Uhrin M. (eds): A Tribute to Bats. Lesnická práce s.r.o., Kostelec nad Černými lesy, 400 pp.
Jahelková H. & Horáček I., 2010: Advertisement behaviour and mating system of the migratory bat Pipistrellus nathusii. Pp.: 302–305. In: Horáček I. & Uhrin M. (eds): A Tribute to Bats. Lesnická práce s.r.o., Kostelec nad Černými lesy, 400 pp.
Královič M., Horáček I. & Černý R., 2010: Mouth development in the Senegal bichir Polypterus senegalus does not involved the oropharyngeal membrane: possible implications for the ecto-endoderm boundary and tooth initiation. Journal of Applied Ichthyology, 26: 179–182.
Martínková N., Bačkor P., Bartonička T., Blažková P., Červený J., Falteisek L., Gaisler J., Hanzal V., Horáček D., Hubálek Z., Jahelková H., Kolařík M., Korytár Ľ., Kubátová A., Lehotská B., Lehotský R., Lučan R. K., Májek O., Matějů J., Řehák Z., Šafář J., Tájek P., Tkadlec E., Uhrin M., Wagner J., Weinfurtová D., Zima J., Zukal J. & Horáček I., 2010: Increasing incidence of Geomyces destructans fungus in bats from the Czech Republic and Slovakia. PlosONE, 5(11): 1–7 [e13853].
ŠpoutilF., Vlček V. & Horáček I., 2010: Enamel microarchitecture of a tribosphenic molar. Journal of Morphology, 271: 1204–1218.
Benda P., Abi-Said M., Bartonička T., Bilgin R., Faizolahi K., Lučan R. K., Nicolaou H., Reiter A., Shohdi W. M., Uhrin M. & Horáček I., 2011: Rousettus aegyptiacus (Pteropodidae) in the Palaearctic: list of records and revision of the distribution range. Vespertilio, 15: 3–36.
Evin A., Horáček I. & Hulva P., 2011: Phenotypic diversification and island evolution of pipistrelle bats (Pipistrellus pipistrellus group) in the Mediterranean region inferred from geometric morphometrics and molecular phylogenetics. Journal of Biogeography, 38: 2091–2105.
Jahelková H., Horáček I., 2011: Mating system of a migratory bat, Nathusius’pipistrelle (Pipistrellus nathusii) : different male strategies. Acta Chiropterologica, 13: 123-137. IF 1,129
Svoboda J., Bochenski Z. M., Čulíková V., Dohnalová A., Hladilová Š., Hložek M., Horáček I., Ivanov M., Králík M., Novák M., Pryor A. J. E., Sázelová S., Stevens R. E., Wilczynski J. & Wojtal P., 2011: Paleolithic hunting in a southern Moravian landscape: The case of Milovice IV, Czech Republic. Geoarchaeology, 26: 838–866.
Wagner J., Čermák S. & Horáček I., 2011: The presence of Ursus ex gr. minimus-thibetanus in the Late Villányian and its position among the Pliocene and Pleistocene black bears in Europe. Quaternaire, Hors-série, 4: 39–58.
Benda P., Vallo P., Hulva P. & Horáček I., 2012: The Egyptian fruit bat Rousettus aegyptiacus (Chiroptera: Pteropodidae) in the Palaearctic: Geographical variation and taxonomic status. Biologia, Bratislava, 67: 1230–1244.
Bilgin R., Gürün K., Maraci Ö., Furman A., Hulva P., Çoraman E., Lučan R. K., Bartonička T. & Horáček I., 2012: Syntopic occurrence in Turkey supports separate species status for Miniopterus schreibersii schrei­bersii and M. schreibersii pallidus (Mammalia: Chiroptera). Acta Chiropterologica, 14: 279–289.
Gregorovičová M., Zahradníček O., Tucker A. S., Velenský P. & Horáček I., 2012: Embryonic develop­ment of the monitor lizard, Varanus indicus. Amphibia-Reptilia, 33: 451–468.
Horáček I., 2012: Bílé nosy u nás aneb Druhý popis [White noses in our country or the Second description]. Vesmír, 91(11): 636–641 (in Czech).
Horáček I. & Špoutil F., 2012: Why tribosphenic? On variation and constraints in developmental dynamics of chiropteran molars. Pp.: 410–455. In: Gunnel G. F. & Simmons N. B. (eds.): Evolutionary History in Bats: Fossils, Molecules and Morphology. Cambridge Studies in Morphology and Molecules – New Paradigms in Evolutionary Biology. Cambridge University Press, Cambridge, xii+572 pp.
Soukup V., Horáček I., Černý R., 2012: Development and evolution of the vertebrate primary mouth. Journal of Anatomy
Hulva P., Marešová T., Dundarova H., Bilgin R., Benda P., Bartonička T. & Horáček I., 2012: Environ­mental margin and island evolution in Middle Eastern populations of the Egyptian fruit bat. Molecular Ecology, 21: 6104–6116.
Zahradníček O., Horáček I. Tucker A. S., 2012: Tooth development in a model reptile: functional and null generation teeth in the gecko Paroedura picta. Journal of Anatomy, 221: 195–208.
Horáček I., Knitlová M., Wagner J., Kordos L., Nadachowski A., 2013: Late Cenozoic history of Micromys (Mammalia, Rodentia) in Central Europe. PlosONE
Horáček I., Maul L.C., Smith K.T., Barkai R., Gopher A., 2013: Bat remains (Mammalia, Chiroptera) from the Middle Pleistocene site of Qesem Cave, Israel, with the first Pleistocene record of fruit bats in the Mediterranean region. Palaeontologia Electronica 16.3.23A
Horáček, I., Bartonička, T., & Lučan, R. K. (2014). Macroecological characteristics of bat geomycosis in the Czech Republic: results of five years of monitoring. Vespertilio, 17, 65-77.
BENDA, P., LUČAN, R. K., SHOHDI, W. M., PORTEŠ, M., & HORÁČEK, I. (2014). Microbats of the Western Oases of Egypt, Libyan Desert. Vespertilio, 17, 45-58.
UHRIN, M., BENDA, P., LUČAN, R., MIKOVÁ, E., RENDOŠ, M., & HORÁČEK, I. (2014). Noteworthy bat records from Romania. Vespertilio, 17, 197-213.
Juřičková, L., Ložek, V., Horáčková, J., Tlachač, P., & Horáček, I. (2014). Holocene succession and biogeographical importance of mollusc fauna in the Western Sudetes (Czech Republic). Quaternary international, 353, 210-224.
Hošek, J., Pokorný, P., Kubovčík, V., Horáček, I., Žáčková, P., Kadlec, J., ... & Bučkuliaková, S. (2014). Late glacial climatic and environmental changes in eastern-central Europe: Correlation of multiple biotic and abiotic proxies from the Lake Švarcenberk, Czech Republic. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 396, 155-172.
Lučan, R. K., Bartonička, T., Benda, P., Bilgin, R., Jedlička, P., Nicolaou, H., ... & Horáček, I. (2014). Reproductive seasonality of the Egyptian fruit bat (Rousettus aegyptiacus) at the northern limits of its distribution. Journal of Mammalogy, 95(5), 1036-1042.
Herdina, A. N., Kelly, D. A., Jahelková, H., Lina, P. H., Horáček, I., & Metscher, B. D. (2015). Testing hypotheses of bat baculum function with 3D models derived from microCT. Journal of Anatomy, 226(3), 229-235.
Svoboda, J., Hladilová, Š., Horáček, I., Kaiser, J., Králík, M., Novák, J., ... & Zikmund, T. (2015). Dolní Věstonice IIa: Gravettian microstratigraphy, environment, and the origin of baked clay production in Moravia. Quaternary international, 359, 195-210.
Häuselmann, P., Mihevc, A., Pruner, P., Horáček, I., Čermák, S., Hercman, H., ... & Bosák, P. (2015). Snežna jama (Slovenia): interdisciplinary dating of cave sediments and implication for landscape evolution. Geomorphology, 247, 10-24.
Řeřucha, Š., Bartonička, T., Jedlička, P., Čížek, M., Hlouša, O., Lučan, R., & Horáček, I. (2015). The BAARA (Biological AutomAted RAdiotracking) system: A new approach in ecological field studies. PloS one, 10(2), e0116785.
Herdina, A. N., Hulva, P., Horáček, I., Benda, P., Mayer, C., Hilgers, H., & Metscher, B. D. (2014). MicroCT imaging reveals morphometric baculum differences for discriminating the cryptic species Pipistrellus pipistrellus and P. pygmaeus. Acta chiropterologica, 16(1), 157-168.
Frick, W. F., Puechmaille, S. J., Hoyt, J. R., Nickel, B. A., Langwig, K. E., Foster, J. T., ... & Herzog, C. (2015). Disease alters macroecological patterns of North American bats. Global Ecology and Biogeography, 24(7), 741-749.
Kallistová, A., Skála, R., Horáček, I., Miyajima, N., & Malíková, R. (2015). Influence of sample preparation on the microstructure of tooth enamel apatite. Journal of Applied Crystallography, 48(3), 763-768.
Hošek, J., Hambach, U., Lisa, L., Grygar, T. M., Horáček, I., Meszner, S., & Knesl, I. (2015). An integrated rock-magnetic and geochemical approach to loess/paleosol sequences from Bohemia and Moravia (Czech Republic): implications for the Upper Pleistocene paleoenvironment in central Europe. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 418, 344-358.
Horáček I. (2015): Biodiverzita střední Evropy a kvartérní paleozoologie. Vesmír  94, 434 -439.
Horáček I. Ložek V., Knitlová M., Juřičková L. (2015): Darkness under candlestick: glacial refugia on mountain glaciers. Pp. 263-377 In: Sázelová S. et al. (eds.): Forgotten times and spaces. New perspectives in paleoanthropological, paleoethnological and archeological studies. CAS Inst. Archeology, Brno. 618 pp.
Horáček I., Bláha V., Wagner J., Čermák S., Žák K., Ryšánek K. (2016): Speleologie a výzkum kvartéru na Chlumu u Srbska: historie a současný  stav. Český kras,  Beroun, 42: 5-22.
Pyšková, K., Storch, D., Horáček, I., Kauzál, O., & Pyšek, P. (2016). Golden jackal (Canis aureus) in the Czech Republic: the first record of a live animal and its long-term persistence in the colonized habitat. ZooKeys, (641), 151.
Bilgin, R., Gürün, K., Rebelo, H., Puechmaille, S. J., Maracı, Ö., Presetnik, P., ... & Fressel, N. (2016). Circum-Mediterranean phylogeography of a bat coupled with past environmental niche modeling: A new paradigm for the recolonization of Europe?. Molecular phylogenetics and evolution, 99, 323-336.
Benda, P., Said, M. A., Jaoude, I. B., Karanouh, R., Lučan, R. K., Sadek, R., ... & Horáček, I. (2016). Bats (Mammalia: Chiroptera) of the Eastern Mediterranean and Middle East. Part 13. Review of distribution and ectoparasites of bats in Lebanon. Acta Soc. Zool. Bohem, 80, 207-316.
BENDA, P., KRUSKOP, S. V., & HORÁČEK, I. (2016). On the occurrence of Rhinolophus lepidus in West Turkestan: data from the Zoological Museum of the Moscow State University. Vespertilio, 18, 11-21.
Lučan, R. K., Bartonička, T., Jedlička, P., Řeřucha, Š., Šálek, M., Čížek, M., ... & Horáček, I. (2016). Spatial activity and feeding ecology of the endangered northern population of the Egyptian fruit bat (Rousettus aegyptiacus). Journal of Mammalogy, 97(3), 815-822.
Bartonička, T., Bandouchova, H., Berková, H., Blažek, J., Lučan, R., Horáček, I., ... & Zukal, J. (2017). Deeply torpid bats can change position without elevation of body temperature. Journal of thermal biology, 63, 119-123.

Kallistová, A., Horáček, I., Šlouf, M., Skála, R., & Fridrichová, M. (2017). Mammalian enamel maturation: Crystallographic changes prior to tooth eruption. PloS one, 12(2), e0171424.
Minarik, M., Stundl, J., Fabian, P., Jandzik, D., Metscher, B. D., Psenicka, M., Horáček, I. & Cerny, R. (2017). Pre-oral gut contributes to facial structures in non-teleost fishes. Nature, 547(7662), 209.
Horáček I., Sázelová S. (2017): Vertebarte fauna development in North Bohemian region during the Holocene. Pp. 35-48 in Svoboda J. (ed.) Mesolithic of Northern Bohemia II. Archeological Inst. AV CR Brno, 247 pp.
Knitlová, M., & Horáček, I. (2017). Late Pleistocene-Holocene paleobiogeography of the genus Apodemus in central Europe. PloS one, 12(3), e0173668.
Knitlová, M., & Horáček, I. (2017). Genus Apodemus in the Pleistocene of Central Europe: when did the extant taxa appear?. Fossil Imprint, 73(3-4), 460-481.
Kallistová, A., Skála, R., Šlouf, M., Čejchan, P., Matulková, I., & Horáček, I. (2018). Enamel apatite crystallinity significantly contributes to mammalian dental adaptations. Scientific reports, 8(1), 5544.
Svoboda, J., Pokorný, P., Horáček, I., Sázelová, S., Abraham, V., Divišová, M., ... & Šída, P. (2018). Late Glacial and Holocene sequences in rockshelters and adjacent wetlands of Northern Bohemia, Czech Republic: Correlation of environmental and archaeological records. Quaternary International, 465, 234-250.
Harazim, M., Horáček, I., Jakešová, L., Luermann, K., Moravec, J. C., Morgan, S., ... & Zukal, J. (2018). Natural selection in bats with historical exposure to white-nose syndrome. BMC Zoology, 3(1), 8.
Nejman, L., Lisá, L., Doláková, N., Horáček, I., Bajer, A., Novák, J., ... & Pacher, M. (2018). Cave deposits as a sedimentary trap for the Marine Isotope Stage 3 environmental record: The case study of Pod Hradem, Czech Republic. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology 497: 201-217.
Pyšková, K., Kauzál, O., Storch, D., Horáček, I., Pergl, J., & Pyšek, P. (2018). Carnivore distribution across habitats in a central-European landscape: a camera trap study. ZooKeys, (770), 227.
Kipson, M., Šálek, M., Lučan, R., Uhrin, M., Maxinová, E., Bartonika, T., ... & Naďo, L. (2018). Foraging Habitat, Home-Range Size and Diet of a Mediterranean Bat Species, Savi's Pipistrelle. Acta Chiropterologica, 20(2), 351-360.
Rofes, J., Cucchi, T., Hanot, P., Herman, J., Stephan, P., Cersoy, S., Horáček, I. & Zazzo, A. (2018). Postglacial recolonization and Holocene diversification of Crocidura suaveolens (Mammalia, Soricidae) on the north-western fringe of the European continent. Quaternary Science Reviews, 190, 1-10.
BENDA, P., SATTERFIELD, L., GÜCEL, S., HORÁČEK, I., LUČAN, R., CHARALAMBIDOU, I., & UHRIN, M. (2018). Distribution of bats in Northern Cyprus (Chiroptera). Lynx, series nova, 49.
Pokorny, R., Zak, K., Jurickova, L., & Horacek, I. (2018). Novy nalez kone (Equus ferus germanicus Nehring, 1804) ze svrchnepleistocennich sprasi ze Stradonic u Nizboru. Zpravy o geologickych vyzkumech, 5101, 25-3.
Stribna, T., Romportl, D., Demjanovič, J., Vogeler, A., Tschapka, M., Benda, P., Horacek, I. & Hulva, P. (2019). Pan African phylogeography and palaeodistribution of rousettine fruit bats: Ecogeographic correlation with Pleistocene climate vegetation cycles. Journal of Biogeography, 46(10), 2336-2349.
Svoboda, J., & Horáček, I. (2019). Between Bilzingleben and Vértésszölös: small-sized industries in the Middle Pleistocene of Europe (Czech Republic). Anthropologie, 57(3), 363-372.
Horáček, I. (2019). Family Rhinopomatidae (Mouse-tailed bats). pp. 164-177  In: Wilson D.E:  Mittermeier R.L. (eds.): Handbook of the Mammals of the World - Volume 9. Batsd. Lynx Edicion, Barcelona.
Horáček, I., Lehmann, T., Ruf, I., Krohmann, K., Maul, L.C. (2019). Gerhard Storch - a legend in mammals research. Fossil Imprint. 75: 5-21.
Horáček, I. & Trávníčková, E. (2019). Myotis gerhardstorchi sp.n. and comments on the European fossil record of Myotis frater group (Mammalia, Chiroptera). Fossil Imprint, 75(3-4), 315-342
Bachorec, E., Horáček, I., Hulva, P., Konečný, A., Lučan, R. K., Jedlička, P., ... & Bartonička, T. (2020). Spatial networks differ when food supply changes: Foraging strategy of Egyptian fruit bats. Plos one, 15(2), e0229110.
Bachorec, E., Horáček, I., Hulva, P., Konečný, A., Lučan, R. K., Jedlička, P., ... & Bartonička, T. (2020). Egyptian fruit bats do not preferentially roost with their relatives. Journal of Zoology, 312(2), 111-121.
Baca, M., Popović, D., Lemanik, A., Baca, K., Horáček, I., & Nadachowski, A. (2019). Highly divergent lineage of narrow-headed vole from the Late Pleistocene Europe. Scientific reports, 9(1), 1-10.
Hajna, N. Z., Bosák, P., Pruner, P., Mihevc, A., Hercman, H., & Horáček, I. (2020). Karst sediments in Slovenia: Plio-Quaternary multi-proxy records. Quaternary International, 546, 4-19.
Baca, M., Popović, D., Baca, K., Lemanik, A., Doan, K., Horáček, I., ... & Nadachowski, A. (2020). Diverse responses of common vole (Microtus arvalis) populations to Late Glacial and Early Holocene climate changes–Evidence from ancient DNA. Quaternary Science Reviews, 233, 106239.
Lučan, R. K., Reiter, A., Chytil, J., Horáček, I., & Bartonička, T. (2020). Pipistrellus kuhlii in the Czech Republic: 2007-2020 (Chiroptera: Vespertilionidae). Lynx, series nova, 51(1): .
Horáček, I. (2020). Obratlovci. pp. 124-127 In: Šída P. & Pokorný P. (eds.): Mezolit severních Čech III. Vývoj pravěké krajiny Českého ráje: Vegetace, fauna, lidé. Dolnověstonické studie 25, Archeologický ústav AV ČR, Brno. 600 pp.
Ptáková, M., Pokorný, P., Šída, P., Novák, J., Horáček, I., Juřičková, L., ... & Poschlod, P. (2020). From Mesolithic hunters to Iron Age herders: a unique record of woodland use from eastern central Europe (Czech Republic). Vegetation History and Archaeobotany, 30(2), 269-286
Riegert, J., Šindelář, J., Zárybnická, M., & Horáček, I. (2021). Large-scale spatial patterns of small-mammal communities in the Mediterranean region revealed by Barn owl diet. Scientific reports, 11(1), 1-16.
Bonilla-Salomón, I., Čermák, S., Luján, À. H., Horáček, I., Ivanov, M., & Sabol, M. (2021). Early Miocene small mammals from mwq1/2001 turtle joint (Mokrá-Quarry, South Moravia, Czech Republic): Biostratigraphical and palaeoecological considerations. Bull Geosci, 96(1), 99-122.
Hajna, N. Z., Mihevc, A., Bosak, P., Pruner, P., Hercman, H., Horáček, I., ... & Švara, A. (2021). Pliocene to Holocene chronostratigraphy and palaeoenvironmental records from cave sediments: Račiška pečina section (SW Slovenia). Quaternary International, 605, 5-24.
Žák, K., Horáček I. & Cílek, V. (2021). Krajina vytvářená řekami a rozpouštěním vápence. pp. 27-47 In: Žák, K., Cílek V. & Majer, M. (eds.) Srdce Českého krasu. Dokořán, Praha  299 pp.
Horáček, I., Čermák, S. & Wagner, J. (2021). Po stopách čtvrtohorního života. pp. 48-68  In: Žák, K., Cílek V. & Majer, M. (eds.) Srdce Českého krasu. Dokořán, Praha  299 pp.
Horáček, i. (2021). Srbsko a netopýři. pp.258-259 In: Žák, K., Cílek V. & Majer, M. (eds.) Srdce Českého krasu. Dokořán, Praha  299 pp.
Horáček, I., Čermák, S. & Wagner, J.,(2021). Prof.RNDr.Oldřich Fejfar CSc. a Český kras. Český kras 47: 61 - 672022
Kipson, M., Gazaryan, S., & Horáček, I. (2022). Savi’s Pipistrelle Hypsugo savii (Bonaparte, 1837). In Handbook of the Mammals of Europe (pp. 1-18). Cham: Springer International Publishing.
Žák K., Adamovič J., Horáček I., Čermák S., Wagner J., Eigner J., Mikysek P. (2022): Co ještě může přinést výzkum jeskyně Nad Kačákem v Českém krasu. – Nepublikovaná výzkumná zpráva, Geologický ústav AV ČR, v. v. i., 67 stran. Praha.
Horáček, I. (2022). From tribosphenic molar to dental phylotype of rodents. Abstr. TMD Štiřín.
Baca, M., Popović, D., Agadzhanyan, A. K., Baca, K., Conard, N. J., Fewlass, H., ...Horacek, I.  & Nadachowski, A. (2023). Ancient DNA of narrow-headed vole reveal common features of the Late Pleistocene population dynamics in cold-adapted small mammals. Proceedings of the Royal Society B, 290(1993), 20222238.

Arbez, L., Tereza, H., Royer, A., Sophie, M., & Ivan, H. (2023). The wood lemming and the development of taiga in Late Pleistocene Central Europe. Quaternary Science Reviews, 303, 107974.
Horáček, I., Hadravová, T., Čermák, S. & Žák, K. Pleistocenní fauna z Kubrychtovy jeskyně v Tetíně v Českém krasu. Český kras 48: 18-22.
Horáček, I. & Lebedová, K. (2022).  Cricetinae in the Quaternary fossil record of the Czech Republic and Slovakia (Rodentia: Cricetidae).   Lynx, n. s. (Praha), 53: 365–41
Horáček, I. & Benda, P. (2023). Vladimír Hanák (1931-2022). Journal of Mammalogy  (3): 1-3.
Benda, P., Ševčík, M., Horáček, I., Uvizl, M., Reiter, A., & Uhrin, M. (2024). Bats (Mammalia: Chiroptera) of the Eastern Mediterranean and Middle East. Part 17. New records of bats and their ectoparasites from Tajikistan with a review of these faunas of the country including a description of a new species of horseshoe bat. Acta Soc. Zool. Bohem, 88, 1-213.
Hošek, J., Pokorný, P., Storch, D., Kvaček, J., Havig, J., Novák, J., ... & Horáček, I. (2024). Hot spring oases in the periglacial desert as the Last Glacial Maximum refugia for temperate trees in Central Europe. Science Advances, 10(22), eado6611.
Pažitková, B., & Horáček, I. (2024). Shrews of tribe Nectogalini (Mammalia, Eulipotyphla, Soricidae) in the fossil record of the Czech Republic and Slovakia. Fossil Imprint, 190-228.
Baca, M., Popović, D., Lemanik, A., Bañuls‐Cardona, S., Conard, N. J., Cuenca‐Bescós, G., ... & Nadachowski, A. (2023). Ancient DNA reveals interstadials as a driver of common vole population dynamics during the last glacial period. Journal of biogeography, 50(1), 183-196.
Arbez, L., Hadravova, T. Royer, A., Mointure, S., Fejfar, O., Horáček, I. (2024). Re-investigation of fossil Lemmini specimens from the early and middle Pleistocene of Western and Central Europe: Evolutionary and paleoenvironmental implications. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology, 641, 112128.
Staňková, M., Lučan, R., & Horáček, I. (2023). Clustering behaviour and acoustic activity of Myotis myotis (Mammalia: Chiroptera) in an undergroung hibernaculum. Acta Soc. Zool. Bohem, 87,
Horáček, I. (2024). K5 Chování a evoluce: případ vzdušných letců.  Pp. 492 -511 In: Špinka, M. et al. (eds). Etologie. Academia, Praha.